RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 HECW1Q76N89 1606 aa28.58■■■□□ 2.17
SPCS1-201ENST00000233025 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SPCS1-201ENST00000233025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.55■■■□□ 2.162e-6■□□□□ 11.3
SPCS1-201ENST00000233025 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SPCS1-201ENST00000233025 MLECQ14165 292 aa28.51■■■□□ 2.15
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SPCS1-201ENST00000233025 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.49■■■□□ 2.15
SPCS1-201ENST00000233025 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.47■■■□□ 2.15
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRTO14522 1441 aa28.43■■■□□ 2.14
SPCS1-201ENST00000233025 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.43■■■□□ 2.14
SPCS1-201ENST00000233025 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.43■■■□□ 2.14
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.42■■■□□ 2.14
SPCS1-201ENST00000233025 ATP10AO60312 1499 aa28.41■■■□□ 2.14
SPCS1-201ENST00000233025 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.36■■■□□ 2.13
SPCS1-201ENST00000233025 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.35■■■□□ 2.13
SPCS1-201ENST00000233025 C3P01024 1663 aa28.35■■■□□ 2.13
SPCS1-201ENST00000233025 PLCH2O75038 1416 aa28.28■■■□□ 2.12
SPCS1-201ENST00000233025 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.27■■■□□ 2.12
SPCS1-201ENST00000233025 KDM5CP41229 1560 aa28.24■■■□□ 2.11
SPCS1-201ENST00000233025 REREQ9P2R6 1566 aa28.24■■■□□ 2.11
SPCS1-201ENST00000233025 NCOA1Q15788 1441 aa28.23■■■□□ 2.11
SPCS1-201ENST00000233025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.23■■■□□ 2.11
SPCS1-201ENST00000233025 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.19■■■□□ 2.1
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD1Q16676 465 aa28.18■■■□□ 2.1
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA6Q8N139 1617 aa28.16■■■□□ 2.1
SPCS1-201ENST00000233025 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.13■■■□□ 2.09
SPCS1-201ENST00000233025 AGLP35573 1532 aa28.11■■■□□ 2.09
SPCS1-201ENST00000233025 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.1■■■□□ 2.09
SPCS1-201ENST00000233025 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SPCS1-201ENST00000233025 KIF14Q15058 1648 aa28.08■■■□□ 2.09
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.07■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.04■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 MROH2AA6NES4 1674 aa28.03■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 AFAP1Q8N556 730 aa28.03■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.02■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.01■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.01■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.99■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 NPATQ14207 1427 aa27.98■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.96■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.95■■■□□ 2.07
SPCS1-201ENST00000233025 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.94■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2R1Q13018 1463 aa27.93■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC1P33527 1531 aa27.92■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.91■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.89■■■□□ 2.06
SPCS1-201ENST00000233025 PREX2Q70Z35 1606 aa27.89■■■□□ 2.05
SPCS1-201ENST00000233025 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.87■■■□□ 2.05
SPCS1-201ENST00000233025 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SPCS1-201ENST00000233025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA1LP34931 641 aa27.84■■■□□ 2.05
SPCS1-201ENST00000233025 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SPCS1-201ENST00000233025 PKD2Q13563 968 aa27.81■■■□□ 2.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYM3Q14202 1370 aa27.8■■■□□ 2.04
SPCS1-201ENST00000233025 EEA1Q15075 1411 aa27.79■■■□□ 2.04
SPCS1-201ENST00000233025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SPCS1-201ENST00000233025 CLIP1P30622 1438 aa27.78■■■□□ 2.04
SPCS1-201ENST00000233025 FMN1Q68DA7 1419 aa27.78■■■□□ 2.04
SPCS1-201ENST00000233025 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.75■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.74■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRKQ15262 1439 aa27.74■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 CPS1P31327 1500 aa27.73■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.72■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 PLXNC1O60486 1568 aa27.71■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 ALKQ9UM73 1620 aa27.7■■■□□ 2.03
SPCS1-201ENST00000233025 PIP4K2BP78356 416 aa27.7■■■□□ 2.02
SPCS1-201ENST00000233025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
SPCS1-201ENST00000233025 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.69■■■□□ 2.02
SPCS1-201ENST00000233025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.67■■■□□ 2.02
SPCS1-201ENST00000233025 TOM1O60784 492 aa27.65■■■□□ 2.02
SPCS1-201ENST00000233025 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.64■■■□□ 2.01
SPCS1-201ENST00000233025 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.63■■■□□ 2.01
SPCS1-201ENST00000233025 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
SPCS1-201ENST00000233025 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.62■■■□□ 2.01
SPCS1-201ENST00000233025 ATP7AQ04656 1500 aa27.61■■■□□ 2.01
SPCS1-201ENST00000233025 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.59■■■□□ 2.01
SPCS1-201ENST00000233025 A2MP01023 1474 aa27.55■■■□□ 2
SPCS1-201ENST00000233025 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.52■■■□□ 2
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.5■■□□□ 1.99
SPCS1-201ENST00000233025 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.48■■□□□ 1.99
SPCS1-201ENST00000233025 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SPCS1-201ENST00000233025 DEPDC5O75140 1603 aa27.45■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 GGT6Q6P531 493 aa27.44■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SPCS1-201ENST00000233025 SYNMO15061 1565 aa27.42■■□□□ 1.98
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