RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221138.8

PPP2CB-201, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP2CB, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-201ENST00000221138 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.77■■■■■ 4.6
PPP2CB-201ENST00000221138 AKNAQ7Z591 1439 aa43.7■■■■■ 4.59
PPP2CB-201ENST00000221138 TONSLQ96HA7 1378 aa43.68■■■■■ 4.58
PPP2CB-201ENST00000221138 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.67■■■■■ 4.58
PPP2CB-201ENST00000221138 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.65■■■■■ 4.58
PPP2CB-201ENST00000221138 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
PPP2CB-201ENST00000221138 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
PPP2CB-201ENST00000221138 MIA2Q96PC5 1412 aa43.59■■■■■ 4.57
PPP2CB-201ENST00000221138 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
PPP2CB-201ENST00000221138 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
PPP2CB-201ENST00000221138 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.54■■■■■ 4.56
PPP2CB-201ENST00000221138 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
PPP2CB-201ENST00000221138 CCER2I3L3R5 266 aa43.48■■■■■ 4.55
PPP2CB-201ENST00000221138 KCNH8Q96L42 1107 aa43.48■■■■■ 4.55
PPP2CB-201ENST00000221138 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.54
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF14Q15058 1648 aa43.37■■■■■ 4.53
PPP2CB-201ENST00000221138 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
PPP2CB-201ENST00000221138 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.34■■■■■ 4.53
PPP2CB-201ENST00000221138 KDM6BO15054 1643 aa43.32■■■■■ 4.53
PPP2CB-201ENST00000221138 ANP32CO43423 234 aa43.3■■■■■ 4.52
PPP2CB-201ENST00000221138 ASXL2Q76L83 1435 aa43.28■■■■■ 4.52
PPP2CB-201ENST00000221138 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.26■■■■■ 4.52
PPP2CB-201ENST00000221138 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
PPP2CB-201ENST00000221138 ROCK1Q13464 1354 aa43.24■■■■■ 4.51
PPP2CB-201ENST00000221138 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
PPP2CB-201ENST00000221138 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.24■■■■■ 4.51
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.19■■■■■ 4.5
PPP2CB-201ENST00000221138 DAPK1P53355 1430 aa43.16■■■■■ 4.5
PPP2CB-201ENST00000221138 MYT1Q01538 1121 aa43.15■■■■■ 4.5
PPP2CB-201ENST00000221138 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.14■■■■■ 4.5
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PPP2CB-201ENST00000221138 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.1■■■■■ 4.49
PPP2CB-201ENST00000221138 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
PPP2CB-201ENST00000221138 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.08■■■■■ 4.49
PPP2CB-201ENST00000221138 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.06■■■■■ 4.48
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCC5O15440 1437 aa43.05■■■■■ 4.48
PPP2CB-201ENST00000221138 TRIM52Q96A61 297 aa43.05■■■■■ 4.48
PPP2CB-201ENST00000221138 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.99■■■■■ 4.47
PPP2CB-201ENST00000221138 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.97■■■■■ 4.47
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.97■■■■■ 4.47
PPP2CB-201ENST00000221138 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
PPP2CB-201ENST00000221138 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
PPP2CB-201ENST00000221138 PREX2Q70Z35 1606 aa42.95■■■■■ 4.47
PPP2CB-201ENST00000221138 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.94■■■■■ 4.46
PPP2CB-201ENST00000221138 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.94■■■■■ 4.46
PPP2CB-201ENST00000221138 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
PPP2CB-201ENST00000221138 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.89■■■■■ 4.46
PPP2CB-201ENST00000221138 WASHC2AQ641Q2 1341 aa42.88■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP42.87■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.86■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 PLCH2O75038 1416 aa42.85■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 L3MBTL2Q969R5 705 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP2CB-201ENST00000221138 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.81■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 ADGRL2O95490 1459 aa42.8■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 NCOA1Q15788 1441 aa42.79■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 FKBP8Q14318 412 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 DIP2BQ9P265 1576 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 GLI2P10070 1586 aa42.76■■■■■ 4.44
PPP2CB-201ENST00000221138 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.75■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 NEFLP07196 543 aa42.74■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 CD109Q6YHK3 1445 aa42.74■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.73■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 PZPP20742 1482 aa42.72■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.71■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.71■■■■■ 4.43
PPP2CB-201ENST00000221138 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.69■■■■■ 4.42
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC7Q96M83 1385 aa42.67■■■■■ 4.42
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.66■■■■■ 4.42
PPP2CB-201ENST00000221138 FOXD1Q16676 465 aa42.66■■■■■ 4.42
PPP2CB-201ENST00000221138 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.64■■■■■ 4.42
PPP2CB-201ENST00000221138 FANCAO15360 1455 aa42.63■■■■■ 4.41
PPP2CB-201ENST00000221138 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
PPP2CB-201ENST00000221138 MBD5Q9P267 1494 aa42.59■■■■■ 4.41
PPP2CB-201ENST00000221138 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.58■■■■■ 4.41
PPP2CB-201ENST00000221138 NBPF8Q3BBV2 869 aa42.57■■■■■ 4.41
PPP2CB-201ENST00000221138 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.56■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 TSPOAP1O95153 1857 aa42.55■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.55■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.55■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.54■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 BCANQ96GW7 911 aa42.54■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCC1P33527 1531 aa42.52■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.51■■■■■ 4.4
PPP2CB-201ENST00000221138 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.5■■■■■ 4.39
PPP2CB-201ENST00000221138 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.5■■■■■ 4.39
PPP2CB-201ENST00000221138 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.5■■■■■ 4.39
PPP2CB-201ENST00000221138 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
PPP2CB-201ENST00000221138 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
PPP2CB-201ENST00000221138 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
PPP2CB-201ENST00000221138 ADGRL1O94910 1474 aa42.43■■■■■ 4.38
PPP2CB-201ENST00000221138 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.42■■■■■ 4.38
PPP2CB-201ENST00000221138 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.41■■■■■ 4.38
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