RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ncoa3O09000 1398 aa36.89■■■■□ 3.5
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mug1P28665 1476 aa36.82■■■■□ 3.49
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa36.69■■■■□ 3.46
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa36.68■■■■□ 3.46
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Hecw2Q6I6G8 1578 aa36.66■■■■□ 3.46
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CntlnA2AM05 1397 aa36.65■■■■□ 3.46
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Synj2Q9D2G5 1434 aa36.63■■■■□ 3.45
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lmod2Q3UHZ5 550 aa36.61■■■■□ 3.45
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Naip2Q9QUK4 1447 aa36.6■■■■□ 3.45
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kiaa0556Q8C753 1610 aa36.57■■■■□ 3.45
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arhgap5P97393 1501 aa36.57■■■■□ 3.44
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Qser1A2BIE1 1698 aa36.51■■■■□ 3.44
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa36.51■■■■□ 3.43
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lemd3Q9WU40 921 aa36.45■■■■□ 3.43
Nelfe-202ENSMUST00000165953 OvosQ3UU35 1456 aa36.43■■■■□ 3.42
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Brwd3A2AHJ4 1799 aa36.41■■■■□ 3.42
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Peg3Q3URU2 1571 aa36.41■■■■□ 3.42
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa36.41■■■■□ 3.42
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kidins220E9Q9B7 1793 aa36.38■■■■□ 3.41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cul9Q80TT8 1865 aa36.37■■■■□ 3.41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cyb5rlB1AS42 316 aa36.37■■■■□ 3.41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Naip1Q9QWK5 1403 aa36.35■■■■□ 3.41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tiam1Q60610 1591 aa36.32■■■■□ 3.41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ptch1Q61115 1434 aa36.32■■■■□ 3.41
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Yeats2Q3TUF7 1407 aa36.31■■■■□ 3.4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trappc8E9PWG2 1437 aa36.28■■■■□ 3.4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa36.28■■■■□ 3.4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tdrd9Q14BI7 1383 aa36.27■■■■□ 3.4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atp10aO54827 1508 aa36.26■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dip2cE9PWR4 1557 aa36.25■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NpatQ8BMA5 1420 aa36.25■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kdm5cP41230 1554 aa36.24■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa36.22■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 RereQ80TZ9 1558 aa36.2■■■■□ 3.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cfap74Q3UY96 1578 aa36.2■■■■□ 3.38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abcc3B2RX12 1523 aa36.18■■■■□ 3.38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Adcy10Q8C0T9 1614 aa36.18■■■■□ 3.38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Camsap2Q8C1B1 1461 aa36.16■■■■□ 3.38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Neurl4Q5NCX5 1563 aa36.14■■■■□ 3.38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Caskin1Q6P9K8 1431 aa36.13■■■■□ 3.37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 MyclP10166 368 aa36.11■■■■□ 3.37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccnb3Q810T2 1396 aa36.09■■■■□ 3.37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cfap65Q3V0B4 1847 aa36.06■■■■□ 3.36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PtprmP28828 1452 aa36.06■■■■□ 3.36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa36.05■■■■□ 3.36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa36.05■■■■□ 3.36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa36.04■■■■□ 3.36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa35.97■■■■□ 3.35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Hecw1Q8K4P8 1604 aa35.91■■■■□ 3.34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Map3k5O35099 1380 aa35.85■■■■□ 3.33
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa35.84■■■■□ 3.33
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa35.8■■■■□ 3.32
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Afap1Q80YS6 731 aa35.76■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trpm1Q2TV84 1622 aa35.75■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 SphkapQ6NSW3 1687 aa35.74■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Talpid3E9PV87 1520 aa35.73■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abca6Q8K441 1624 aa35.73■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nos1Q9Z0J4 1429 aa35.71■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fhod3Q76LL6 1578 aa35.7■■■■□ 3.31
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gli2Q0VGT2 1544 aa35.68■■■■□ 3.3
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Myom2Q14BI5 1463 aa35.67■■■■□ 3.3
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mtus2Q3UHD3 1353 aa35.58■■■■□ 3.29
Nelfe-202ENSMUST00000165953 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa35.57■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fmn2Q9JL04 1578 aa35.56■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prdm16A2A935 1275 aa35.55■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Abcc5Q9R1X5 1436 aa35.54■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trpm2Q91YD4 1506 aa35.54■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mast1Q9R1L5 1570 aa35.53■■■■□ 3.28
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif3bQ61771 747 aa35.49■■■■□ 3.27
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Topaz1E5FYH1 1653 aa35.45■■■■□ 3.27
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Scn4aQ9ER60 1841 aa35.42■■■■□ 3.26
Nelfe-202ENSMUST00000165953 RictorQ6QI06 1708 aa35.41■■■■□ 3.26
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Uggt2E9Q4X2 1504 aa35.37■■■■□ 3.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cabp1Q9JLK7 227 aa35.37■■■■□ 3.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plch2A2AP18 1501 aa35.36■■■■□ 3.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa35.34■■■■□ 3.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rsph4aQ8BYM7 716 aa35.34■■■■□ 3.25
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