RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Jph4Q80WT0 628 aa29.98■■■□□ 2.39
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prex2Q3LAC4 1598 aa29.95■■■□□ 2.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mtus2Q3UHD3 1353 aa29.92■■■□□ 2.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AknaQ80VW7 1404 aa29.92■■■□□ 2.38
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa29.87■■■□□ 2.37
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fancd2Q80V62 1450 aa29.84■■■□□ 2.37
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zfp644E9QA22 1323 aa29.67■■■□□ 2.34
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kif21bQ9QXL1 1668 aa29.67■■■□□ 2.34
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29.55■■■□□ 2.32
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.5■■■□□ 2.31
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Neurl4Q5NCX5 1563 aa29.45■■■□□ 2.31
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Trappc8E9PWG2 1437 aa29.4■■■□□ 2.3
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pprc1Q6NZN1 1644 aa29.4■■■□□ 2.3
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.39■■■□□ 2.3
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hecw1Q8K4P8 1604 aa29.38■■■□□ 2.29
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.38■■■□□ 2.29
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ssh2Q5SW75 1423 aa29.31■■■□□ 2.28
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Anks4bQ8K3X6 423 aa29.3■■■□□ 2.28
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29.25■■■□□ 2.27
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Znf608Q56A10 1511 aa29.23■■■□□ 2.27
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mbd5B1AYB6 1498 aa29.2■■■□□ 2.27
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PtprtQ99M80 1454 aa29.2■■■□□ 2.26
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29.19■■■□□ 2.26
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prdm16A2A935 1275 aa29.18■■■□□ 2.26
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Asxl1P59598 1514 aa29.17■■■□□ 2.26
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ncoa1P70365 1447 aa29.13■■■□□ 2.25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AI481877A2ALV5 1481 aa29.13■■■□□ 2.25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.11■■■□□ 2.25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rgl3Q3UYI5 709 aa29.1■■■□□ 2.25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zfyve16Q80U44 1528 aa29.09■■■□□ 2.25
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rock1P70335 1354 aa29.06■■■□□ 2.24
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mug2P28666 1451 aa29.06■■■□□ 2.24
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cd109Q8R422 1442 aa29.05■■■□□ 2.24
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Robo2Q7TPD3 1470 aa29.03■■■□□ 2.24
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Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa29.02■■■□□ 2.24
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