RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dip2cE9PWR4 1557 aa35.45■■■■□ 3.27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp10aO54827 1508 aa35.44■■■■□ 3.26
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtus2Q3UHD3 1353 aa35.12■■■■□ 3.21
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhh2Q8C115 1491 aa35.06■■■■□ 3.2
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MyclP10166 368 aa35.06■■■■□ 3.2
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prdm16A2A935 1275 aa35.04■■■■□ 3.2
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprmP28828 1452 aa35.03■■■■□ 3.2
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpm1Q2TV84 1622 aa35.03■■■■□ 3.2
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SphkapQ6NSW3 1687 aa35■■■■□ 3.19
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa34.83■■■■□ 3.17
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plch2A2AP18 1501 aa34.79■■■■□ 3.16
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uggt2E9Q4X2 1504 aa34.76■■■■□ 3.16
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa34.73■■■■□ 3.15
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