RNA–Protein interactions for RNA: YPL232W

SSO1, Transcript of Plasma membrane t-SNARE, yeast

Gene SSO1, Length 873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSO1	YPL232W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	VPS75	P53853	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	BSC2	Q05611	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	PST1	Q12355	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	AI1	P03875	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MOD5	P07884	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YCL068C	P25593	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	HXT1	P32465	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	SPC42	P36094	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	VHC1	P38329	1120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	TAT2	P38967	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	END3	P39013	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MNT3	P40549	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	KAP114	P53067	1004 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	RPN14	P53196	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	INN1	P53901	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MPS1	P54199	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	SPP2	Q02521	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	AGE1	Q04412	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	XYL2	Q07993	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	IMA2	Q08295	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	UPC2	Q12151	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	COX17	Q12287	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	BLM10	P43583	2143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	PEX5	P35056	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	RRN10	P38204	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	OM14	P38325	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	INM1	P38710	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	GGC1	P38988	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MET30	P39014	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	SCC4	P40090	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	NDE1	P40215	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MEP1	P40260	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	OSW7	P43611	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	TIM54	P47045	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YJR149W	P47177	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YGR015C	P53208	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	ATG4	P53867	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	SOV1	Q04748	898 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	NUS1	Q12063	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MDM32	Q12171	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SSO1	YPL232W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	RPB10	P22139	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	SSH4	P32343	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	NFU1	P32860	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	TDA11	P38854	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YMR134W	P40207	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YSA1	Q01976	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MMT2	Q08970	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MET32	Q12041	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	GLO4	Q12320	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	ICT1	Q12385	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	CDC21	P06785	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	PEP5	P12868	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	ATP12	P22135	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YMC1	P32331	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	KKQ8	P36004	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	ICE2	P40499	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YFL012W	P43580	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	BIO3	P50277	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	KXD1	P53158	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	BTN2	P53286	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	BAG7	Q12128	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSO1	YPL232W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	RAD57	P25301	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	MGR1	P25573	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	SRB4	P32569	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	BEM3	P32873	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	TCD1	P38756	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	YDR089W	P38966	869 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	MNN1	P39106	762 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	TOK1	P40310	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	STB2	P46679	850 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSO1	YPL232W	MDM34	P53083	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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