RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	NCB2	Q92317	146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SLY1	P22213	666 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CPR4	P25334	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PHA2	P32452	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NUP2	P32499	720 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	KAP122	P32767	1081 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UBA4	P38820	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AKR1	P39010	764 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PCL6	P40038	420 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PMT5	P52867	743 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PPT1	P53043	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YNR062C	P53748	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YPL068C	Q02749	293 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	EEB1	Q02891	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	BCH1	Q05029	724 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	REH1	Q06709	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	THI73	Q07904	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HFI1	Q12060	488 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HAL9	Q12180	1030 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ATP14	Q12349	124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YBT1	P32386	1661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MGR1	P25573	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ATP7	P30902	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MCD4	P36051	919 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	POP4	P38336	279 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	XDJ1	P39102	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CEM1	P39525	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RMD6	P39975	231 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HXT14	P42833	540 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	COG5	P53951	403 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UBX4	P54730	416 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	COQ9	Q05779	260 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YLR283W	Q05867	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	BCP1	Q06338	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YOR012W	Q12351	137 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPN6	Q12377	434 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SAS5	Q99314	248 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HIS5	P07172	385 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	PET54	P10834	293 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	INO1	P11986	533 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MIP1	P15801	1254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CCA1	P21269	546 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FPS1	P23900	669 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	HCM1	P25364	564 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	CTS1	P29029	562 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SCM4	P32564	187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	SEF1	P34228	1148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	FHL1	P39521	936 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	EXO1	P39875	702 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	RFC2	P40348	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	NUP82	P40368	713 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	MAM33	P40513	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DOT5	P40553	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	UFD1	P53044	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DOC1	P53068	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YGR122W	P53272	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
EXO1	YOR033C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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