RNA–Protein interactions for RNA: YLR063W

BMT6, Methyltransferase required for m3U2843 methylation of the 25S rRNA, yeast

Gene BMT6, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BMT6	YLR063W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.03	□□□□□ -0.8	not detected
BMT6	YLR063W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	SPR6	Q01684	191 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	MSC2	Q03455	724 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	APC4	Q04601	652 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	SWC7	Q06707	132 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	REH1	Q06709	432 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	ICL2	Q12031	575 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	NUS1	Q12063	375 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BMT6	YLR063W	GAL80	P04387	435 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	PTM1	P32857	523 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	FLR1	P38124	548 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	CEM1	P39525	442 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SWD1	P39706	426 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	FKH2	P41813	862 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	GTO1	P48239	356 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	STB4	P50104	949 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MON1	P53129	644 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SHY1	P53266	389 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	GND2	P53319	492 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SMA1	Q02651	245 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	PMT7	Q06644	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	HSP42	Q12329	375 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	AFI1	Q99222	893 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	COX5A	P00424	153 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	CIT2	P08679	460 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	STF2	P16965	84 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.01	□□□□□ -0.81	not detected
BMT6	YLR063W	TKL2	P33315	681 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	RIB1	P38066	345 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	FHL1	P39521	936 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YAR028W	P39548	234 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ROM1	P53046	1155 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MET13	P53128	600 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YNR063W	P53749	607 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	STP1	Q00947	519 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ABZ2	Q03266	374 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	HRD3	Q05787	833 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YPR196W	Q06595	470 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MCD1	Q12158	566 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	PTC6	P25646	442 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	PET112	P33893	541 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	CTF13	P35203	478 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YHR045W	P38775	560 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	VAC8	P39968	578 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MXR1	P40029	184 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	HOC1	P47124	396 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	RRN5	Q02983	363 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	TAF12	Q03761	539 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	FIN1	Q03898	291 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MFG1	Q07684	458 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	GPB1	Q08886	897 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	RPN6	Q12377	434 aa		10	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	GIT1	P25346	518 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YCL049C	P25577	312 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	STE14	P32584	239 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ARN2	P38724	620 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	DMA1	P38823	416 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ATG7	P38862	630 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MEP1	P40260	492 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ESL1	P40456	1118 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	CDC1	P40986	491 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	GYP8	P43570	497 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MSE1	P48525	536 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	HXT15	P54854	567 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	NUP100	Q02629	959 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YDR344C	Q05510	147 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	VTA1	Q06263	330 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	YLL007C	Q07799	665 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	THP1	Q08231	455 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.99	□□□□□ -0.81	not detected
BMT6	YLR063W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	MNL2	Q12205	849 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	NFI1	Q12216	726 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SVS1	Q12254	260 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	SUT2	Q12286	268 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	JLP1	Q12358	412 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
BMT6	YLR063W	PBS2	P08018	668 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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