RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	TRE2	Q08693	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SOG2	Q08817	791 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	LCB4	Q12246	624 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ICT1	Q12385	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SPT3	P06844	337 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	OCA4	P25366	362 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	UBC8	P28263	218 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NUP2	P32499	720 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CDC5	P32562	705 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MRPL6	P32904	214 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	STB6	P36085	766 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RIB1	P38066	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	LDB7	P38210	180 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FMP23	P38231	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ECM8	P38246	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	EFM1	P38732	585 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YHR202W	P38887	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SLX8	P40072	274 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ALG8	P40351	577 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YIR007W	P40566	764 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	FAR7	P43592	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GLG2	P47011	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BIR1	P47134	954 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YJR115W	P47152	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	COG5	P53951	403 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SPR6	Q01684	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	IRC15	Q02733	499 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PPN1	Q04119	674 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	ARP10	Q04549	284 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RIF2	Q06208	395 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MCP2	Q06567	569 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MFG1	Q07684	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
UBX7	YBR273C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	NTG2	Q08214	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	JLP1	Q12358	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MDM12	Q92328	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	APM4	Q99186	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RIB3	Q99258	208 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MET17	P06106	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RSR1	P13856	272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MIH1	P23748	554 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PHO3	P24031	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	DCC1	P25559	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PPZ1	P26570	692 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PEP7	P32609	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MRPL40	P36534	297 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YBR225W	P38321	900 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ARP1	P38696	384 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GAB1	P41733	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	BST1	P43571	1029 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
UBX7	YBR273C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SAP4	P53036	818 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ORM1	P53224	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AGE1	Q04412	482 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	BCH1	Q05029	724 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
UBX7	YBR273C	RPN6	Q12377	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TRM10	Q12400	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	FRT1	Q99332	602 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TEC1	P18412	486 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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