RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 C1orf159Q96HA4 380 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 EXOC2Q96KP1 924 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC140Q96MF4 163 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 RWDD3Q9Y3V2 267 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 A0A1W2PQJ5 194 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 C7orf72A4D263 438 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 MAP4K2Q12851 820 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 NR0B2Q15466 257 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 C2orf27AQ580R0 203 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.63□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 SHISA4Q96DD7 197 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCNK12Q9HB15 430 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.63□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 FUCA1P04066 466 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 GLI1P08151 1106 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 SQSTM1Q13501 440 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 NTRK3Q16288 839 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 BICRALQ6AI39 1079 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 DPF3Q92784 378 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 LZTR1Q8N653 840 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.61□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.61□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 ASXL2Q76L83 1435 aa4.61□□□□□ -1.67
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RNU6-685P-201ENST00000517088 SNX17Q15036 470 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 MLANAQ16655 118 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 IQCEQ6IPM2 695 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 CEP68Q76N32 757 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF605Q86T29 641 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-685P-201ENST00000517088 C22orf46C9J442 243 aa4.59□□□□□ -1.67
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