RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	LAC1	P28496	418 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	KAE1	P36132	386 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.76	□□□□□ -1.81	not detected
UBP12	YJL197W	SSO2	P39926	295 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ELO3	P40319	345 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	MUP1	P50276	574 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PRM1	P53835	661 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ATG9	Q12142	997 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	COX1	P00401	534 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ARG81	P05085	880 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YUH1	P35127	236 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	NUP133	P36161	1157 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	VHS2	P40463	436 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDR132C	Q03900	495 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	UFO1	Q04511	668 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RAD61	Q99359	647 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YLR358C	O13565	187 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CDC20	P26309	610 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RAD14	P28519	371 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PLB1	P39105	664 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ELO1	P39540	310 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ASG1	P40467	964 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ECM18	Q04623	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	TDA6	Q06466	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	SRN2	Q99176	213 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	MTR10	Q99189	972 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	SPE2	P21182	396 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	BOS1	P25385	244 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	FMP52	P40008	231 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YGR266W	P53326	701 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	BUD17	P53727	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YMR160W	Q03823	816 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	LCB4	Q12246	624 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CBP1	P07252	654 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	GAL7	P08431	366 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PPH22	P23595	377 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ELF1	P36053	145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ARA1	P38115	344 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YGR035C	P53222	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YLR224W	Q05947	369 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	DCS1	Q06151	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	AMD2	P22580	549 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PHO11	P35842	467 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PFF1	P38244	976 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	MMS4	P38257	691 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PHO12	P38693	467 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CIN4	P39110	191 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YNL092W	P53934	400 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RTT109	Q07794	436 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDL176W	Q12027	708 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDL177C	Q12257	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YIP4	P53093	235 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RKI1	Q12189	258 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	APL3	P38065	1025 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YPT10	P38146	199 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ICS2	P38284	255 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	SIL1	Q08199	421 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	VAM3	Q12241	283 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RHO2	P06781	192 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	HNM1	P19807	563 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YFL066C	P43538	392 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	PTR3	P43606	678 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CHD1	P32657	1468 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YIM1	P28625	365 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	GIP4	P39732	760 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	YDR541C	Q03049	344 aa		3.73	□□□□□ -1.81
UBP12	YJL197W	RRT8	Q08219	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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