RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	VPS36	Q06696	566 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RLM1	Q12224	676 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RAP1	P11938	827 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ERS1	P17261	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SAG1	P20840	650 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	HXT1	P32465	570 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PTR2	P32901	601 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	NNK1	P36003	928 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
MDV1	YJL112W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CIN1	P40987	1014 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	MAF1	P41910	395 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SSY5	P47002	699 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	BIT61	P47041	543 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	BRO1	P48582	844 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SDH1	Q00711	640 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RRN11	Q04712	507 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	NDL1	Q06568	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	VAC14	Q06708	880 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	AEP3	Q12089	606 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	OSW2	Q12202	724 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YOL107W	Q12239	342 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	GAL3	P13045	520 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CDC23	P16522	626 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YPK2	P18961	677 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CKA2	P19454	339 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SEC62	P21825	274 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PEX1	P24004	1043 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	URK1	P27515	501 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ZIP1	P31111	875 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	DEP1	P31385	405 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SRB5	P32585	307 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	OCT1	P35999	772 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	TUL1	P36096	758 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YHR045W	P38775	560 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SMF2	P38778	549 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YHR182W	P38870	785 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	FAD1	P38913	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YJL107C	P42947	387 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	NMD5	P46970	1048 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	COS12	P53053	380 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YGR117C	P53270	476 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YGR126W	P53274	230 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SKO1	Q02100	647 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RPM2	Q02773	1202 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PDS5	Q04264	1277 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CRF1	Q04930	467 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	FUS2	Q05670	677 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	FRE3	Q08905	711 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	DFG16	Q99234	619 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ATG2	P53855	1592 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	MSF1	P08425	469 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	GTS1	P40956	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	FKH2	P41813	862 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	YFL066C	P43538	392 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	COS5	P47187	383 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	RMR1	P53060	241 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	YGR067C	P53243	804 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	MUK1	Q02866	612 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	URH1	Q04179	340 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	COS7	Q07788	383 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	RTT109	Q07794	436 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	TLG2	Q08144	397 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDV1	YJL112W	RDR1	Q08904	546 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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