RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 NEK2P51955 445 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GUCY2DQ02846 1103 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 OCA2Q04671 838 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ARMT1Q9H993 441 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 EFCAB14O75071 495 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TMOD1P28289 359 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 MORC3Q14149 939 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 MAML1Q92585 1016 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GSDMAQ96QA5 445 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CYTH2Q99418 400 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 OCRLQ01968 901 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DEUP1Q05D60 604 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 BBOF1Q8ND07 529 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 RAPGEF5Q92565 580 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HESX1Q9UBX0 185 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CFLARO15519 480 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TTI1O43156 1089 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GDAP1Q8TB36 358 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CPA1P15085 419 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PMLP29590 882 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HACD3Q9P035 362 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TBK1Q9UHD2 729 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SKIP12755 728 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ADCY1Q08828 1119 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCDQ96DY2 449 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKG1Q13976 671 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ING2Q9H160 280 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TMED2Q15363 201 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HIF1AQ16665 826 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GPBP1Q86WP2 473 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR91A4D1P6 747 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DESI2Q9BSY9 194 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 MSH2P43246 934 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP36Q96G28 342 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KLC3Q6P597 504 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 K7ENM7 598 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TSC22D3Q99576 134 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC27A2O14975 620 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX5P35711 763 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 BBS5Q8N3I7 341 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SNX19Q92543 992 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 PTPREP23469 700 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 TLK1Q9UKI8 766 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 E2F6O75461 281 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 NCLNQ969V3 563 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 RAPGEF3O95398 923 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTN1P12814 892 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNA8P32881 189 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 GIPC2Q8TF65 315 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 IL16Q14005 1332 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 MCF2LO15068 1137 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 TECP42680 631 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-207ENST00000613246 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms