RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PSMC6P62333 389 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 DEFB103AP81534 67 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SEPT2Q15019 361 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SPATA5Q8NB90 893 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 PITPNM1O00562 1244 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 BAG3O95817 575 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 IQCF3P0C7M6 154 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 RPAINQ86UA6 219 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 WWC1Q8IX03 1113 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 BANK1Q8NDB2 785 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 XAGE2Q96GT9 111 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 USP44Q9H0E7 712 aa14.23□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SPTBN2O15020 2390 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 MYH1P12882 1939 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 STAT3P40763 770 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ6P48051 423 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 TIMM10P62072 90 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ARMCX2Q7L311 632 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 TLK2Q86UE8 772 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 RAD9AQ99638 391 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CABP5Q9NP86 173 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.22□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GUL7 405 aa14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 PTGS1P23219 599 aa14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 GPNMBQ14956 572 aa14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CLDND1Q9NY35 253 aa14.21□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 STXBP3O00186 592 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 VWA5AO00534 786 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 KDM4AO75164 1064 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 MCAMP43121 646 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 GABPAQ06546 454 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 PTPROQ16827 1216 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 FRYLO94915 3013 aa14.2□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 MYO7AQ13402 2215 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 TBX10O75333 385 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 CLUL1Q15846 466 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 MCTP2Q6DN12 878 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 VCPKMTQ9H867 229 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 TNFAIP2Q03169 654 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 TCTN1Q2MV58 587 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 TMX2Q9Y320 296 aa14.18□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 ST3GAL2Q16842 350 aa14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 COPRSQ9NQ92 184 aa14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 RIPK3Q9Y572 518 aa14.17□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 H3BNC9 293 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 NCK2O43639 380 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 ZEB2O60315 1214 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 SMPD1P17405 629 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 PLCD1P51178 756 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 EPC2Q52LR7 807 aa14.16□□□□□ -0.14
HCG18-241ENST00000602290 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms