RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 CACNB3P54284 484 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SREBF2Q12772 1141 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ARMC3Q5W041 872 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CAPNS2Q96L46 248 aa8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 USP17L5A8MUK1 530 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 TBC1D8O95759 1140 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 PTH1RQ03431 593 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 C17orf99Q6UX52 265 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 DGKHQ86XP1 1220 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 OPTNQ96CV9 577 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ECEL1O95672 775 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 GNRH1P01148 92 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 TUBB4AP04350 444 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 BACE1P56817 501 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 NKX3-2P78367 333 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 NEDD4P46934 1319 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 USP17L12C9JPN9 530 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 USP17L21D6R901 530 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 H0YHG0 523 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 FIBPO43427 364 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 F13A1P00488 732 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CYP21A2P08686 494 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CYP2D6P10635 497 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CETPP11597 493 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 INPP5BP32019 993 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CCZ1BP86790 482 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.7□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 TPM1P09493 284 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 OAZ1P54368 228 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SNAPC2Q13487 334 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SARM1Q6SZW1 724 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SMIM22K7EJ46 135 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MYBL2P10244 700 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 LMAN1P49257 510 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ANTXR2P58335 489 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 RINLQ6ZS11 566 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 WRNIP1Q96S55 665 aa8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PRG0 241 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 STX6O43752 255 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 USP14P54578 494 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 FBXW7Q969H0 707 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 FDX1P10109 184 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 LIG1P18858 919 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 LIFRP42702 1097 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 UBXN4Q92575 508 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 MCM8Q9UJA3 840 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 SLC27A2O14975 620 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 AKR1B1P15121 316 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.68□□□□□ -1.02
USP4-211ENST00000485450 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.68□□□□□ -1.02
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