RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472461.1

SZRD1-205, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SZRD1, Length 843 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-205ENST00000472461 EFCC1Q9HA90 598 aa21.47■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 RNF146Q9NTX7 359 aa21.47■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 FBXO40Q9UH90 709 aa21.47■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 STK36Q9NRP7 1315 aa21.47■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SZRD1-205ENST00000472461 BECN1Q14457 450 aa21.46■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 WASF1Q92558 559 aa21.46■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
SZRD1-205ENST00000472461 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.45■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.45■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.45■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.45■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 ACAD9Q9H845 621 aa21.45■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.45■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 FOXN1O15353 648 aa21.44■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 NAPAP54920 295 aa21.44■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 GPR142Q7Z601 462 aa21.44■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.44■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 ERO1AQ96HE7 468 aa21.44■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.44■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.44■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 STXBP3O00186 592 aa21.43■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 STRNO43815 780 aa21.43■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 FCER1AP12319 257 aa21.43■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.43■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.43■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 ALG1Q9BT22 464 aa21.43■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.43■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 NFIBO00712 420 aa21.42■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 XBP1P17861 261 aa21.42■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 KCTD2Q14681 263 aa21.42■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.42■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.42■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.42■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 CTGFP29279 349 aa21.41■■□□□ 1.02
SZRD1-205ENST00000472461 TRIM47Q96LD4 638 aa21.41■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.4■■□□□ 1.02
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SZRD1-205ENST00000472461 POLR2MP0CAP2 368 aa21.38■■□□□ 1.01
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SZRD1-205ENST00000472461 ADCY7P51828 1080 aa21.38■■□□□ 1.01
SZRD1-205ENST00000472461 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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SZRD1-205ENST00000472461 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SZRD1-205ENST00000472461 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SZRD1-205ENST00000472461 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.38■■□□□ 1.01
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