RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX58Q96C10 678 aa24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.81■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E2F4Q16254 413 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA20Q8TB22 786 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BIN1O00499 593 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXN1O15353 648 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXLNAP40222 546 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCTP2Q6DN12 878 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO11Q86XK2 927 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQUBQ8NA54 791 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AK8Q96MA6 479 aa24.8■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DOCK1Q14185 1865 aa24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAF1Q13077 416 aa24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2SQ16763 222 aa24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDIL3O43854 480 aa24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.78■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BECN2A8MW95 431 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOOK2Q96ED9 719 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR29P0C7W0 189 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP3B2Q13367 1082 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SARM1Q6SZW1 724 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM160B2Q86V87 743 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCE1Q969G3 411 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAGE5Q96GU1 130 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR9Q96QG7 549 aa24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF15Q66K64 600 aa24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.76■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ESPNB1AK53 854 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEIS2O14770 477 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMC2O95347 1197 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEDQ86YR6 584 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCB2Q00722 1185 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DISC1Q9NRI5 854 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FEM1BQ9UK73 627 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.75■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L15C9J2P7 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L11C9JVI0 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L18D6R9N7 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L22D6RA61 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L19D6RCP7 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L20D6RJB6 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IKBKBO14920 756 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNAP25P60880 206 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L24Q0WX57 530 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MORC3Q14149 939 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALCRLQ16602 461 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPAR1Q92633 364 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.74■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDP2O95551 362 aa24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP6P22004 513 aa24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBA7P41226 1012 aa24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPYDQ12882 1025 aa24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO3Q9BYT9 981 aa24.73■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMTNL1A8MU46 457 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3CDO00329 1044 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC37A4O43826 429 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.551e-6■■□□□ 14.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP11P51784 963 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MLKLQ8NB16 471 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSDMAQ96QA5 445 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FEZ1Q99689 392 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT17Q9BSW7 474 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms