RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221448.9

SNRNP70-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNRNP70, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70-201ENST00000221448 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.06■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.05■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 NFIBO00712 420 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 CDKL5O76039 1030 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 ACAD9Q9H845 621 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 JAK2O60674 1132 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 COPB2P35606 906 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PKN1Q16512 942 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 TKFCQ3LXA3 575 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 CHST13Q8NET6 341 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 DDX11Q96FC9 970 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 MMP19Q99542 508 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PNMA2Q9UL42 364 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 ABCB11O95342 1321 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PLXNB2O15031 1838 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 FCER1AP12319 257 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 SCG2P13521 617 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 NSMFQ6X4W1 530 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 GABRQQ9UN88 632 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SNRNP70-201ENST00000221448 PTPREP23469 700 aa26.01■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 TBC1D5Q92609 795 aa26.01■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 AIFM3Q96NN9 605 aa26.01■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 FBXO40Q9UH90 709 aa26.01■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 TRIM17Q9Y577 477 aa26.01■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 PGK2P07205 417 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 KCTD2Q14681 263 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 SNX21Q969T3 373 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 DEXIO95424 95 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 ADORA2AP29274 412 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 PRKCZQ05513 592 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 STXBP3O00186 592 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 OPLAHO14841 1288 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 STRNO43815 780 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 NAPAP54920 295 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 TRAF1Q13077 416 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 GRB14Q14449 540 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 HSCBQ8IWL3 235 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 GJD2Q9UKL4 321 aa25.99■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 CFBP00751 764 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 MORN1Q5T089 497 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 BARHL2Q9NY43 387 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 STK36Q9NRP7 1315 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 CYP2B6P20813 491 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 FLT3LGP49771 235 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 ARHGEF6Q15052 776 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 SRRDQ9UH36 339 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 COBLO75128 1261 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 CALML3P27482 149 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 FOSBP53539 338 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 DPP9Q86TI2 863 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 SHISA4Q96DD7 197 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 HOXD10P28358 340 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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SNRNP70-201ENST00000221448 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP70-201ENST00000221448 GNRH1P01148 92 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 CNTN2Q02246 1040 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 MAP2K5Q13163 448 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 PFASO15067 1338 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 SMCO2A6NFE2 343 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.742e-7■□□□□ 9.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP70-201ENST00000221448 USP6NLQ92738 828 aa25.94■■□□□ 1.74
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