RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sept3Q9Z1S5 350 aa25.27■■□□□ 1.64
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa25.27■■□□□ 1.64
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myh7bA2AQP0 1941 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn3aA2ASI5 1947 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnajc25A2ALW5 357 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm20503G3UZK1 150 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ms4a2P20490 235 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddit3P35639 168 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PtprcapQ64697 197 aa25.26■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Unc80Q8BLN6 3261 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc1a4O35874 532 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 OplahQ8K010 1288 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bst2Q8R2Q8 172 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DaglbQ91WC9 669 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Krt84Q99M73 603 aa25.25■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf326O88291 580 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PcQ05920 1178 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem151bQ68FE7 561 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tdp1Q8BJ37 609 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Jakmip1Q8BVL9 626 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hic1Q9R1Y5 733 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pate3B3GLJ3 98 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FpgsP48760 587 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ercc3P49135 783 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cnnm2Q3TWN3 875 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ErmnQ5EBJ4 281 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atp13a3Q5XF89 1219 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhobtb2Q91V93 728 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PdhbQ9D051 359 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Efcc1Q9JJF6 558 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrelpQ9JK53 378 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DmwdQ08274 665 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mcph1Q7TT79 822 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Otop3Q80UF9 577 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtmr4Q91XS1 1190 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sall1Q9ER74 1322 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Capn2O08529 700 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tlk2O55047 718 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Samhd1Q60710 627 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Agbl2Q8CDK2 862 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tshz3Q8CGV9 1081 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb43Q9DAI4 467 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp53P15975 1069 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atf7Q8R0S1 413 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Necab2Q91ZP9 389 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SpibO35906 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Phka1P18826 1241 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Traf1P39428 409 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm1587Q3UT80 123 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grxcr1Q50H32 290 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fscn1Q61553 493 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Crb2Q80YA8 1282 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ms4a5Q810P8 197 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Defb36Q8K3U4 67 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PolkQ9QUG2 852 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Metap2O08663 478 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RabggtbP53612 339 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif20aP97329 887 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pou2f2Q00196 463 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp943Q6NZP4 507 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc44a1Q6X893 653 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dis3lQ8C0S1 1053 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup133Q8R0G9 1155 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtmr14Q8VEL2 648 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zmym2Q9CU65 1376 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxl16A2RT62 479 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cst8P32766 142 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Xkr5Q5GH66 676 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tacc1Q6Y685 774 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 QarsQ8BML9 775 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arid3bQ9Z1N7 568 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DgkhD3YXJ0 1156 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LdhbP16125 334 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf19aP50636 840 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mkl2P59759 1080 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Psmc6P62334 389 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pla2g6P97819 807 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Skap1Q3UUV5 355 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myo19Q5SV80 963 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elf1Q60775 612 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam170aQ66LM6 333 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dalrd3Q6PJN8 538 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms