Protein–RNA interactions for Protein: A2AQP0

Myh7b, Myosin-7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh7bA2AQP0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Myh7bA2AQP0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Myh7bA2AQP0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Myh7bA2AQP0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Myh7bA2AQP0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Myh7bA2AQP0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Myh7bA2AQP0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Myh7bA2AQP0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Myh7bA2AQP0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Myh7bA2AQP0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Myh7bA2AQP0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Myh7bA2AQP0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Myh7bA2AQP0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Myh7bA2AQP0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Myh7bA2AQP0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Myh7bA2AQP0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Myh7bA2AQP0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Myh7bA2AQP0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Myh7bA2AQP0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Myh7bA2AQP0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Myh7bA2AQP0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Myh7bA2AQP0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Myh7bA2AQP0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Myh7bA2AQP0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Myh7bA2AQP0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Myh7bA2AQP0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Myh7bA2AQP0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Myh7bA2AQP0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Myh7bA2AQP0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Myh7bA2AQP0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Myh7bA2AQP0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Myh7bA2AQP0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Myh7bA2AQP0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Myh7bA2AQP0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Myh7bA2AQP0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Myh7bA2AQP0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Myh7bA2AQP0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Myh7bA2AQP0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Myh7bA2AQP0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Myh7bA2AQP0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Myh7bA2AQP0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Myh7bA2AQP0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Myh7bA2AQP0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myh7bA2AQP0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Myh7bA2AQP0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Myh7bA2AQP0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myh7bA2AQP0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Myh7bA2AQP0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myh7bA2AQP0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Myh7bA2AQP0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Myh7bA2AQP0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Myh7bA2AQP0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Myh7bA2AQP0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Myh7bA2AQP0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Myh7bA2AQP0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Myh7bA2AQP0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myh7bA2AQP0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Myh7bA2AQP0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Myh7bA2AQP0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Myh7bA2AQP0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Myh7bA2AQP0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Myh7bA2AQP0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Myh7bA2AQP0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Myh7bA2AQP0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Myh7bA2AQP0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Myh7bA2AQP0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Myh7bA2AQP0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Myh7bA2AQP0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Myh7bA2AQP0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Myh7bA2AQP0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Myh7bA2AQP0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Myh7bA2AQP0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Myh7bA2AQP0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Myh7bA2AQP0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Myh7bA2AQP0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Myh7bA2AQP0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Myh7bA2AQP0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myh7bA2AQP0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myh7bA2AQP0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Myh7bA2AQP0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Myh7bA2AQP0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Myh7bA2AQP0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Myh7bA2AQP0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Myh7bA2AQP0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Myh7bA2AQP0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Myh7bA2AQP0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Myh7bA2AQP0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Myh7bA2AQP0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myh7bA2AQP0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Myh7bA2AQP0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Myh7bA2AQP0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Myh7bA2AQP0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Myh7bA2AQP0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Myh7bA2AQP0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Myh7bA2AQP0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Myh7bA2AQP0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Myh7bA2AQP0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Myh7bA2AQP0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Myh7bA2AQP0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myh7bA2AQP0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms