RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D HEM3P28789 327 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPL9P31334 269 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D BEM3P32873 1128 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D PDR3P33200 976 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SQT1P35184 431 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YHI9P38765 294 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D UBA4P38820 440 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SPC97P38863 823 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D NDE1P40215 560 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MNT3P40549 630 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D PFA3P42836 336 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ATG36P46983 293 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YJL049WP47048 450 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YJR039WP47107 1121 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YJR149WP47177 404 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR015CP53208 328 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YNR021WP53723 404 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SLT2Q00772 484 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YPL109CQ02981 657 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YET3Q07451 203 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D FRA1Q07825 749 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D IRC13Q08630 104 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D RUD3Q12234 484 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D RGS2Q99188 309 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D TEL1P38110 2787 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D IRA2P19158 3079 aa3.21□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D AI4P03878 556 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D CUP1-1P0CX80 61 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D CUP1-2P0CX81 61 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.2□□□□□ -1.9not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D PRP6P19735 899 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D IMG1P25626 169 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ATP11P32453 318 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MEI5P32489 222 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SRB5P32585 307 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SKN1P33336 771 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D OAR1P35731 278 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SET3P36124 751 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ETR1P38071 380 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YRO2P38079 344 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR112CP38716 378 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D NPT1P39683 429 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D HOS4P40480 1083 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MAD2P40958 196 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YNL320WP42840 284 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YFL012WP43580 148 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MIC19P43594 170 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YJR030CP47101 745 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D COS12P53053 380 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D EFM5P53200 248 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR053CP53234 283 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SUR7P54003 302 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D RNT1Q02555 471 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR444WQ04093 687 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D STP3Q05937 343 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YDL121CQ07541 149 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D XYL2Q07993 356 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YOL024WQ08172 172 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SLD7Q08457 257 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR056CQ12025 205 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D IOC2Q12072 812 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ATG29Q12092 213 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D YOL107WQ12239 342 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D GPR1Q12361 961 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ICT1Q12385 394 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D RMP1Q12530 201 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SRN2Q99176 213 aa3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D STE3P06783 470 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SPS1P08458 490 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D HOM3P10869 527 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D CLN2P20438 545 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D ARG1P22768 420 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPL32P25348 183 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D VAC17P25591 423 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D BUD14P27637 709 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D SFA1P32771 386 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D COX13P32799 129 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D HES1P35843 434 aa3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPL15P36523 253 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms