RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	GEX2	P36173	615 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FAD1	P38913	306 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GIP2	P40036	548 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GTS1	P40956	396 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YJL107C	P42947	387 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GTO1	P48239	356 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PET117	Q02771	107 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TPP1	Q03796	238 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GGA1	Q06336	557 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	AIM41	Q12032	185 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YOL107W	Q12239	342 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YPR089W	O13585	888 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	VPS33	P20795	691 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GEX1	P25596	615 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RDS1	P25611	832 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YCR061W	P25639	631 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SCC4	P40090	624 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SDS3	P40505	327 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BIT61	P47041	543 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MND1	P53102	219 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TIM21	P53220	239 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SPO19	Q03029	223 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ATG23	Q06671	453 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	VAC14	Q06708	880 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FRE3	Q08905	711 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	AEP3	Q12089	606 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RLM1	Q12224	676 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BMT6	Q12291	365 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	NTO1	Q12311	748 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SFG1	Q12507	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SGS1	P35187	1447 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	AI1	P03875	834 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FBP1	P09201	348 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SAC7	P17121	654 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	UGA1	P17649	471 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STE11	P23561	717 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SRB5	P32585	307 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TUL1	P36096	758 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TAE1	P38340	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
TOP1	YOL006C	PET100	P38958	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STN1	P38960	494 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SAK1	P38990	1142 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YER085C	P40058	173 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YNL195C	P40168	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MRK1	P50873	501 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGL185C	P53100	379 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RTC4	P53850	401 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SKO1	Q02100	647 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RSN1	Q03516	953 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GTO3	Q04806	366 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CRN1	Q06440	651 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SEC12	P11655	471 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	URA4	P20051	364 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CLN1	P20437	546 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PEX1	P24004	1043 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GID7	P25569	745 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YCL068C	P25593	260 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	URK1	P27515	501 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YBR139W	P38109	508 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	EHT1	P38295	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FTR1	P40088	404 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TED1	P40533	473 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FKH2	P41813	862 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RET3	P53600	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	REC102	Q02721	264 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FIN1	Q03898	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ERV41	Q04651	352 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PPH22	P23595	377 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ADH7	P25377	361 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MSR1	P38714	643 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YHR078W	P38799	552 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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