RNA–Protein interactions for RNA: YNL143C

YNL143C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNL143C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL143C	YNL143C	RXT2	P38255	430 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	LCB2	P40970	561 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	TCB2	P48231	1178 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	MRK1	P50873	501 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YGR016W	P53209	190 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YTP1	P53584	459 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	VPS9	P54787	451 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	IRC3	Q06683	689 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	SUT2	Q12286	268 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	AFI1	Q99222	893 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	RAP1	P11938	827 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	BOS1	P25385	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	PXL1	P36166	706 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	ICS2	P38284	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	ANS1	P38832	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	CIN1	P40987	1014 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	PTR3	P43606	678 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	STB2	P46679	850 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YNL058C	P53947	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	COQ9	Q05779	260 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	APL4	Q12028	832 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	RPN13	O13563	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	BI2	P03873	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YNL143C	YNL143C	YME1	P32795	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	MDL1	P33310	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	ARP1	P38696	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	MSR1	P38714	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	PAC2	P39937	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	GYL1	Q04322	720 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	SOV1	Q04748	898 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	VTA1	Q06263	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	IRC10	Q08118	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	SPT7	P35177	1332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	CLB2	P24869	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	YCR006C	P25350	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	THI2	P38141	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	DBP8	P38719	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	CAJ1	P39101	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	TAP42	Q04372	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNL143C	YNL143C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	CPR2	P23285	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	PPH22	P23595	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	RML2	P32611	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	TFB1	P32776	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YKL100C	P34248	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	ORC5	P50874	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	RSM23	Q01163	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	FMP30	Q02883	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	MSS51	P32335	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	TOA1	P32773	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	OCT1	P35999	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	CIN4	P39110	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YIL166C	P40445	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YJL107C	P42947	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
YNL143C	YNL143C	STU2	P46675	888 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YJL055W	P47044	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	AIM22	P47051	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	ASI1	P54074	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	PDR8	Q06149	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	BSP1	Q06604	576 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	MCH4	Q08268	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	GPM3	Q12326	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	CLC1	P17891	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL143C	YNL143C	NUP1	P20676	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 190.4 ms