RNA–Protein interactions for RNA: YHR203C

RPS4B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS4B, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS4B	YHR203C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	COQ2	P32378	372 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PET112	P33893	541 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TAF14	P35189	244 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	EMC3	P36039	253 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ARA1	P38115	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YBP1	P38315	674 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RCK2	P38623	610 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SMF2	P38778	549 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YAR028W	P39548	234 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	FAU1	P40099	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ALG8	P40351	577 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	IME4	P41833	600 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PXA1	P41909	870 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SSU1	P41930	458 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	BTN2	P53286	410 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ZRG17	P53735	605 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NUP100	Q02629	959 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RSM10	Q03201	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	BLS1	Q06071	122 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GIC2	Q06648	383 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MRL1	Q06815	381 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GRS2	Q06817	618 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	BSC6	Q08280	497 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CKI1	P20485	582 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ROX1	P25042	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PTP1	P25044	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RAD57	P25301	460 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NTH1	P32356	751 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	IME2	P32581	645 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PHO11	P35842	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LDB7	P38210	180 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PHO12	P38693	467 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	END3	P39013	349 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YMR134W	P40207	237 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	OSW7	P43611	510 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ALY2	P47029	1046 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HXT16	P47185	567 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RTA1	P53047	317 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YPR003C	P53394	754 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SUR7	P54003	302 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HXT15	P54854	567 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
RPS4B	YHR203C	TRS31	Q03337	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	VID22	Q05934	901 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	APL4	Q12028	832 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RAD10	P06838	210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	DUT1	P33317	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MRPL37	P36532	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MRP21	P38175	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ATG14	P38270	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YSW1	P38280	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YHR033W	P38690	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YHR045W	P38775	560 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GIC1	P38785	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MTG2	P38860	518 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CAJ1	P39101	391 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YEL073C	P39974	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	SCC4	P40090	624 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CFD1	P40558	293 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RPC17	P47076	161 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	TAH11	P47112	604 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PMT3	P47190	753 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	GND2	P53319	492 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	FRE4	P53746	719 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	PET117	Q02771	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RRN11	Q04712	507 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	STP3	Q05937	343 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	AIM41	Q12032	185 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	IRA1	P18963	3092 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS4B	YHR203C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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