RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W CPR4P25334 318 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PEX3P28795 441 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W IRE1P32361 1115 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PAH1P32567 862 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W JEN1P36035 616 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ADE17P38009 592 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PTC7P38797 343 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NVJ1P38881 321 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W STL1P39932 569 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YGR210CP42942 411 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W LCL3P53153 274 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ADE16P54113 591 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FRE3Q08905 711 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YPL272CQ08984 517 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TGS1Q12052 315 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DFG16Q99234 619 aa5.11□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MET17P06106 444 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TCP1P12612 559 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PFK1P16861 987 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NPR1P22211 790 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YCR051WP25631 222 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SSE2P32590 693 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PCA1P38360 1216 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W UBA4P38820 440 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W EGD2P38879 174 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DIE2P50076 525 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GPG1P53130 126 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VOA1P53262 265 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W UAF30Q08747 228 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FYV7Q12247 151 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TY3B-GQ99315 1547 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SPT3P06844 337 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TRK1P12685 1235 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W AAC3P18238 307 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MIH1P23748 554 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W IMG1P25626 169 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CIN8P27895 1000 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MLS1P30952 554 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SAC1P32368 623 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DAL3P32459 195 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HXT1P32465 570 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MAL32P38158 584 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YBR071WP38243 211 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TRM5P38793 499 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPN3P40016 523 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BIR1P47134 954 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W AMA1P50082 593 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RSM27P53305 110 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MAL12P53341 584 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VID22Q05934 901 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BUR2Q05949 395 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YPR196WQ06595 470 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RBD2Q12270 262 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VCX1Q99385 411 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MRP13P12686 339 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SNT1P25357 1226 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RSA4P25382 515 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GCD11P32481 527 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SAC6P32599 642 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TCA17P32613 152 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ETR1P38071 380 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ARA1P38115 344 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MAP2P38174 421 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W POA1P38218 177 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W UBX7P38349 436 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W STB5P38699 743 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W APM2P38700 605 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W STT3P39007 718 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HXT14P42833 540 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MRPS18P42847 217 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VPS62P53285 467 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TOF2Q02208 771 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RAD30Q04049 632 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DFG5Q05031 458 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ATG20Q07528 640 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RCN2Q12044 265 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPN6Q12377 434 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GTT2Q12390 233 aa5.1□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPN13O13563 156 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CDC42P19073 191 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RNR1P21524 888 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W AAT2P23542 418 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DBP2P24783 546 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CMK1P27466 446 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PTP2P29461 750 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ATP7P30902 174 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 170.7 ms