RNA–Protein interactions for RNA: YBR229C

ROT2, Transcript of Glucosidase II catalytic subunit, yeast

Gene ROT2, Length 2,865 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROT2	YBR229C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	HER1	Q12276	1246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YVC1	Q12324	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CMK2	P22517	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YCR099C	P25657	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	COX13	P32799	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	HMT1	P38074	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ECM13	P38195	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RBG1	P39729	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YRB2	P40517	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	FKH2	P41813	862 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YJR107W	P47145	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PEX21	P50091	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SFB2	P53953	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TAF12	Q03761	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TRM12	Q04235	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RSB1	Q08417	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	IOC2	Q12072	812 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MAM3	Q12296	706 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ICT1	Q12385	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	APM4	Q99186	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	HTA2	P04912	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TPK3	P05986	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PHO3	P24031	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ATO2	P32907	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YKL100C	P34248	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CTF13	P35203	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MRPL17	P36528	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YHR045W	P38775	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RGI2	P40188	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YJL070C	P40361	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SPR6	Q01684	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SWP1	Q02795	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GPI17	Q04080	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PEX12	Q04370	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ENT2	Q05785	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	NUT2	Q06213	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	JLP1	Q12358	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ADD66	P36040	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ACO2	P39533	789 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YEL023C	P39992	682 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SLX8	P40072	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CLD1	P53264	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SHY1	P53266	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YNR068C	P53754	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ARP4	P80428	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RIF2	Q06208	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GPI11	Q06636	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	REH1	Q06709	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	REP1	P03871	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ARG3	P05150	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SPT3	P06844	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MRPL32	P25348	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YBR056W	P38081	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SIF2	P38262	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YBR225W	P38321	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PEX18	P38855	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	AYR1	P40471	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GCD10	P41814	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	KEL2	P50090	882 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ORC3	P54790	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PIR3	Q03180	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RSN1	Q03516	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SUT2	Q12286	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MED11	Q99278	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MRP13	P12686	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	SPC34	P36131	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	YPK3	P38070	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	ARP1	P38696	384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	KRE29	P40026	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROT2	YBR229C	SWP82	P43554	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.7 ms