RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 LDHCP07864 332 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 GNAI3P08754 354 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM27P14373 513 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 TRIB2Q92519 343 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 GDF15Q99988 308 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 BCAR3O75815 825 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 HMGCRP04035 888 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 GSTO1P78417 241 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 WDR18Q9BV38 432 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 RPTORQ8N122 1335 aa8.05□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPC1 479 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ESPNB1AK53 854 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 SYN1P17600 705 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2B6P20813 491 aa8.04□□□□□ -1.12
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HOXD8-202ENST00000429017 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB33Q86T24 672 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PALD1Q9ULE6 856 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 FOCADQ5VW36 1801 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PFASO15067 1338 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 FLT1P17948 1338 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 OIP5O43482 229 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 GNAI2P04899 355 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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HOXD8-202ENST00000429017 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
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HOXD8-202ENST00000429017 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ADAM32Q8TC27 787 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 USP6NLQ92738 828 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PORCNQ9H237 461 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 LAMA3Q16787 3333 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CNMDO75829 334 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 RHOQP17081 205 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CAPN2P17655 700 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 BMP8BP34820 402 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 HERVK_113P62684 666 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.03□□□□□ -1.12
HOXD8-202ENST00000429017 ASNSP08243 561 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 COL6A1P12109 1028 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 COL8A1P27658 744 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 Q7L0L9 218 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXD8-202ENST00000429017 SSH3Q8TE77 659 aa8.02□□□□□ -1.13
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