RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C ADE1P27616 306 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HRR25P29295 494 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MCM5P29496 775 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C URA10P30402 227 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GUT1P32190 709 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMC1P32331 307 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SSH4P32343 579 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NTH1P32356 751 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SFP1P32432 683 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NIP1P32497 812 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STE14P32584 239 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPR1P32603 445 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NFU1P32860 256 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UBC6P33296 250 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SKN1P33336 771 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C KES1P35844 434 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C KKQ8P36004 724 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DOA1P36037 715 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STB6P36085 766 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FMP46P36141 133 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPF2P36160 344 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PIM1P36775 1133 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ETR1P38071 380 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data0.69□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C DSF2P38213 736 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPP381P38282 291 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR259WP38338 688 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TAE1P38340 232 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REI1P38344 393 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR033WP38690 423 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DED81P38707 554 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OCA5P38738 679 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SMF2P38778 549 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PCL5P38794 229 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR182WP38870 785 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FAA3P39002 694 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CCT2P39076 527 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CAJ1P39101 391 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ACO2P39533 789 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ELO1P39540 310 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NPT1P39683 429 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C EMP65P40085 556 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SCC4P40090 624 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RGI2P40188 164 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TIF34P40217 347 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LRO1P40345 661 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PFK26P40433 827 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C COA1P40452 197 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL152WP40455 235 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NDC80P40460 691 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL086CP40503 102 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MNT3P40549 630 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C INA22P40576 216 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPS6P40583 537 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ALA1P40825 983 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC27P41811 889 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GCD10P41814 478 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TES1P41903 349 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ZIM17P42844 174 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPG5P42933 373 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MIC19P43594 170 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PTR3P43606 678 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CNN1P43618 361 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NUP85P46673 744 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CIS3P47001 227 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BIR1P47134 954 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT16P47185 567 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TIS11P47977 285 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARH1P48360 493 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRF5P48561 642 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RIM21P48565 533 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MNN10P50108 393 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TEL2P53038 688 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BOL2P53082 120 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LCL3P53153 274 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C COG7P53195 279 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SWC4P53201 476 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR015CP53208 328 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SHY1P53266 389 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR266WP53326 701 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SNO2P53823 222 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SLM2P53955 656 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT15P54854 567 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARP4P80428 489 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM9Q02202 377 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PET117Q02771 107 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YML131WQ03102 365 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRS31Q03337 283 aa0.69□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GOT1Q03554 138 aa0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.6 ms