RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	BEM4	P39011	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RGI2	P40188	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ATM1	P40416	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YIL086C	P40503	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	IRR1	P40541	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	HXT8	P40886	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PHB1	P40961	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RFX1	P48743	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TIM13	P53299	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	HDA3	Q06623	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RAX1	Q08760	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YSR3	P23501	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YCR102C	P25608	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ORC2	P32833	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	CTF13	P35203	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	CAB3	P36076	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YRO2	P38079	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YGR111W	P53265	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	FRE4	P53746	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TPP1	Q03796	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	OMS1	Q06668	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TEN1	Q07921	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SFL1	P20134	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	VPS34	P22543	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YSP3	P25036	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	BUD14	P27637	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PEP12	P32854	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ATO2	P32907	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SOL2	P37262	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YNL296W	YNL296W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YAT2	P40017	923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GAT1	P43574	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	NNF1	P47149	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SAP4	P53036	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ROT1	Q03691	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ARP9	Q05123	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GRS2	Q06817	618 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GAL7	P08431	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GPA1	P08539	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YNL296W	YNL296W	AIM26	P32858	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SFC1	P33303	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MBP1	P39678	833 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	KHA1	P40309	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YJL049W	P47048	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	EFM6	P53970	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	NUP53	Q03790	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	IRC13	Q08630	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	AKR2	Q12013	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GTT2	Q12390	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	NSI1	Q12457	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TSC13	Q99190	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	COX1	P00401	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	HAP4	P14064	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	CLN1	P20437	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	PHO87	P25360	923 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	MEI4	P29467	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	ELM1	P32801	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	YET1	P35723	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	STB6	P36085	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	RIM11	P38615	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	YEL020C	P39994	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	SIW14	P53965	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	IVY1	Q04934	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	BLS1	Q06071	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	VTA1	Q06263	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL296W	YNL296W	GID7	P25569	745 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms