RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YDL121C	Q07541	149 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	HXT9	P40885	567 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	SGM1	P47166	707 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	ESBP6	P53918	673 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	BET4	Q00618	327 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	NUP53	Q03790	475 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YKU80	Q04437	629 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YLR281C	Q05863	155 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	ATG26	Q06321	1198 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YDL218W	Q07629	317 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	SRL1	Q08673	210 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	BUD7	Q08754	746 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YDR056C	Q12025	205 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	ENT1	Q12518	454 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YPK3	P38070	525 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	DBP8	P38719	431 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	ELO1	P39540	310 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	TMA108	P40462	946 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	IAH1	P41734	238 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	HUA2	Q12134	243 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	SEM1	O94742	89 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	PGS1	P25578	521 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	TSC10	P38342	320 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SPC24	YMR117C	ARG81	P05085	880 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YCK1	P23291	538 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YCR043C	P25361	127 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	PDR3	P33200	976 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	PHO90	P39535	881 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YIL169C	P40442	995 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YIL060W	P40519	144 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YML037C	Q03703	340 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	EKI1	Q03764	534 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YMR254C	Q04838	102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	KAR3	P17119	729 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SAN1	P22470	610 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YIH1	P25637	258 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RKM3	P38222	552 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ANS1	P38832	159 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	MET30	P39014	640 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YGR127W	P53275	312 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RSF1	Q05043	376 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	AAC3	P18238	307 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	GID7	P25569	745 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	EFM2	P38347	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	AFG3	P39925	761 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RTS2	P40962	232 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	FAR3	P46671	204 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	GRC3	Q07845	632 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RDR1	Q08904	546 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	PUT2	P07275	575 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	MGR1	P25573	417 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	POL4	P25615	582 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ARP1	P38696	384 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	UBA4	P38820	440 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RGI2	P40188	164 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	EFM6	P53970	246 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	ECM30	Q06673	1274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RTT109	Q07794	436 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	TEN1	Q07921	160 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	FLC2	P39719	783 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	PTR3	P43606	678 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	PKP2	P53170	491 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SOL4	P53315	255 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	FMP42	Q04991	504 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YLR352W	Q06479	807 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	GRS2	Q06817	618 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	YPL272C	Q08984	517 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	SNF3	P10870	884 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SPC24	YMR117C	RAD24	P32641	659 aa		5.16	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.9 ms