RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeastyeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STF2YGR008C NDD1Q08887 554 aa1.3□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YOR387CQ08910 206 aa1.3□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PER33Q12144 273 aa1.3□□□□□ -2.2
STF2YGR008C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data1.3□□□□□ -2.2not detected
STF2YGR008C CAR1P00812 333 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C TOP3P13099 656 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C THR1P17423 357 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ARF2P19146 181 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C MNE1P24720 663 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C DSS4P32601 143 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PMT1P33775 817 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PXA2P34230 853 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C MTR2P34232 184 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C SLD2P34252 453 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C MUD2P36084 527 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C GMH1P36125 273 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YNG2P38806 282 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C FHL1P39521 936 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C AVT2P39981 480 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C BAP3P41815 604 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C FHN1P53279 174 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C SCW4P53334 386 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C HOL1P53389 586 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YMR160WQ03823 816 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C RRN11Q04712 507 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ZPS1Q12512 249 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C SPO24Q3E752 67 aa1.29□□□□□ -2.2
STF2YGR008C BLM10P43583 2143 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C COX1P00401 534 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PHO5P00635 467 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C BCY1P07278 416 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C DAL7P21826 554 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YCK1P23291 538 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C RIT1P23796 513 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C SNT1P25357 1226 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PRD1P25375 712 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C CDC13P32797 924 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C UGP1P32861 499 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C REC104P33323 182 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C SHE3P38272 425 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ICS2P38284 255 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C FET3P38993 636 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C LYS9P38999 446 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C DHH1P39517 506 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YEL057CP39983 233 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C MIT1P40002 666 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PRE6P40303 254 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C CCT5P40413 562 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C FIS1P40515 155 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data1.28□□□□□ -2.2not detected
STF2YGR008C HXT16P47185 567 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C MTR3P48240 250 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YNL146WP53906 100 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C VPS16Q03308 798 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PRM6Q04705 352 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C PIN3Q06449 215 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data1.28□□□□□ -2.2not detected
STF2YGR008C YOL029CQ08187 201 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C IES4Q08561 116 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ULA1Q12059 462 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C YDR262WQ12331 272 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa1.28□□□□□ -2.2
STF2YGR008C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C HMG1P12683 1054 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C IMG1P25626 169 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C RPB9P27999 122 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C PRR1P28708 518 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C HOG1P32485 435 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C GDA1P32621 518 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C KKQ8P36004 724 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C PXL1P36166 706 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C MRPL15P36523 253 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YMC2P38087 329 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C ECM13P38195 257 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YHR054CP38780 354 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C UFE1P41834 346 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C ENP2P48234 707 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TPO2P53283 614 aa1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
STF2YGR008C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TEF1P02994 458 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C SPS100P13130 326 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C CDC26P14724 124 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C AMD1P15274 810 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TUP1P16649 713 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C AGP1P25376 633 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C COT1P32798 439 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YKL069WP36088 180 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C MMS4P38257 691 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C VID24P38263 362 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YHR210CP38893 341 aa1.26□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YER188WP40103 239 aa1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms