RNA–Protein interactions for RNA: YDR288W

NSE3, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	YDR288W	GLO1	P50107	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	SGF73	P53165	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YGR127W	P53275	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	NGL3	Q03210	505 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	GSH2	Q08220	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	NMD4	Q12129	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ARG81	P05085	880 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	KAR3	P17119	729 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	REG2	P38232	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ICS2	P38284	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RMD8	P43620	662 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MDV1	P47025	714 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MAK10	Q02197	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	CTI6	Q08923	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
NSE3	YDR288W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MRP7	P12687	371 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MIA40	P36046	403 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ANS1	P38832	159 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	NDE1	P40215	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	FAR3	P46671	204 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	IZH1	Q03419	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	CAC2	Q04199	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	GRC3	Q07845	632 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	TEN1	Q07921	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	CBP1	P07252	654 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	UBP11	P36026	717 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	TSC10	P38342	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	SGM1	P47166	707 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	MRX6	P48564	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	VID30	P53076	958 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ECI1	Q05871	280 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YEH1	Q07804	573 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	CBS1	P14066	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	IMG1	P25626	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YBR144C	P34215	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YBR225W	P38321	900 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	BOP3	P53958	396 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	EFM6	P53970	246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	MFB1	Q04922	465 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	TAH18	Q12181	623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	UBX3	Q12229	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RGT2	Q12300	763 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	SPE4	Q12455	300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RTP1	Q12751	981 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	EDE1	P34216	1381 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	MET8	P15807	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	BOS1	P25385	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	PGS1	P25578	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	GAC1	P28006	793 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	SEF1	P34228	1148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ASK1	P35734	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	JNM1	P36224	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YIL060W	P40519	144 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
NSE3	YDR288W	GAT1	P43574	510 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YGR066C	P53242	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	VPS75	P53853	264 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	SEC5	P89102	971 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	CIR2	Q08822	631 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RDR1	Q08904	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YPT6	Q99260	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ROT2	P38138	954 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RGI2	P40188	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	ALG5	P40350	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	MAF1	P41910	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	IPI3	P53877	555 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	YNL181W	P53878	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NSE3	YDR288W	RSM23	Q01163	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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