RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 SPDYE6P0CI01 402 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM5Q9C035 493 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.53■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC25BP30305 580 aa24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 OGFOD1Q8N543 542 aa24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ESYT2A0FGR8 921 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 USP49Q70CQ1 688 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 CPVLQ9H3G5 476 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 BIN1O00499 593 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 GNA11P29992 359 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 POSTNQ15063 836 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.51■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 NAPAP54920 295 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF543Q08ER8 600 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 DLGAP5Q15398 846 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 PIGSQ96S52 555 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 C6orf50Q9HD87 102 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 NYAP2Q9P242 653 aa24.5■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 IKBKBO14920 756 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 MKL1Q969V6 931 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SMTNL1A8MU46 457 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 MCM7P33993 719 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 EPSTI1Q96J88 318 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.49■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 HOMER1Q86YM7 354 aa24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA20Q8TB22 786 aa24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.48■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SMCO2A6NFE2 343 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXN1O15353 648 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SLFN14P0C7P3 912 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A087X0B3 334 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM196BA6NMK8 535 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 LAD1O00515 517 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 NCAPHQ15003 741 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 PDILTQ8N807 584 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.47■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SLURP2P0DP57 97 aa24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 CSRNP1Q96S65 589 aa24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 TPM4P67936 248 aa24.45■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP2B2Q01814 1243 aa24.45■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 IL17AQ16552 155 aa24.45■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 SPC24Q8NBT2 197 aa24.45■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM151AQ8WW52 585 aa24.45■■□□□ 1.51
SNRNP25-201ENST00000293861 MMP14P50281 582 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 CXCL9Q07325 125 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 INF2Q27J81 1249 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 JDP2Q8WYK2 163 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCE1Q969G3 411 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.45■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 PRR29P0C7W0 189 aa24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPHP41219 470 aa24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF4Q8WV16 495 aa24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms