RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	REV1	P12689	985 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	KIN3	P22209	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PHO3	P24031	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PSO2	P30620	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	AIM26	P32858	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CSG2	P35206	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RRN3	P36070	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ECM13	P38195	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SAW1	P39735	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SDS3	P40505	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	HFM1	P51979	1187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PPM1	Q04081	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SVS1	Q12254	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ECM3	Q99252	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	GPA1	P08539	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CTS1	P29029	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	XRS2	P33301	854 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PIK1	P39104	1066 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CDC1	P40986	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	UFE1	P41834	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	NMA2	P53204	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ESBP6	P53918	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	TAF9	Q05027	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YAP7	Q08182	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CIR2	Q08822	631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	DDC1	Q08949	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ARP7	Q12406	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SAN1	P22470	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RPD3	P32561	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	APM3	P38153	483 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SPC72	P39723	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	HEM14	P40012	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	MAD3	P47074	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YJR079W	P47126	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	MRX6	P48564	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	FLC3	P53121	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ARP4	P80428	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	HRD3	Q05787	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	XYL2	Q07993	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	AFT2	Q08957	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CDC26	P14724	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	DAL2	P25335	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RPC82	P32349	654 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	HXT4	P32467	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	NGG1	P32494	702 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	STE13	P33894	931 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	TFC3	P34111	1160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YBR053C	P38235	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	CCZ1	P38273	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	LAM1	P38851	1228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	MEF2	P39677	819 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RAD26	P40352	1085 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SMK1	P41808	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RMD8	P43620	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	RTT101	P47050	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ZIP2	P53061	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PCL10	P53124	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PUS2	P53167	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SPC19	Q03954	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	ARO80	Q04052	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	GYL1	Q04322	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	MCH5	Q08777	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	THI21	Q08975	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	VPS54	Q12071	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SPS1	P08458	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	GSY2	P27472	705 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	TOA1	P32773	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SLC1	P33333	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SDS22	P36047	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN9	YMR270C	PPE1	P38796	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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