RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	MSS2	P40990	351 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	GSM1	P42950	618 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SMC3	P47037	1230 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	KTR6	P54070	446 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ATG21	Q02887	496 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	BUD7	Q08754	746 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YOR352W	Q08816	343 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	HIR3	P47171	1648 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PRC1	P00729	532 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	BUD14	P27637	709 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RPC82	P32349	654 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MEI5	P32489	222 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	SEC66	P33754	206 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	POA1	P38218	177 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TDP1	P38319	544 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MLH1	P38920	769 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	CEP3	P40969	608 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	FMS1	P50264	508 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	PPM1	Q04081	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	GGA1	Q06336	557 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	AIM6	Q07716	390 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TMA16	Q08687	178 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	CMC1	P36064	111 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YKR015C	P36111	568 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MRPL37	P36532	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	STV1	P37296	890 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	STN1	P38960	494 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	ASG1	P40467	964 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	MND2	P40577	368 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	TAF4	P50105	388 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	EXG2	P52911	562 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	YGL138C	P53122	345 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	XYL2	Q07993	356 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	RTC1	Q08281	1341 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MDV1	YJL112W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	TPK2	P06245	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PET122	P10355	254 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ITR1	P30605	584 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PMT1	P33775	817 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SLM4	P38247	162 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	OSH7	P38755	437 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ZRG8	P40021	1076 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SER3	P40054	469 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	GID8	P40208	455 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ALG5	P40350	334 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YFR018C	P43599	363 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	TIM21	P53220	239 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YGR045C	P53229	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	NCE103	P53615	221 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PGA2	P53903	129 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YNL144C	P53907	740 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	TRS31	Q03337	283 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YLR173W	Q06247	608 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YPR196W	Q06595	470 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	NUS1	Q12063	375 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	GPR1	Q12361	961 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SFG1	Q12507	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	RAD61	Q99359	647 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	VPS63	O13549	108 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SNF5	P18480	905 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	STE11	P23561	717 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YCR061W	P25639	631 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	SUA5	P32579	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	YKL070W	P36087	169 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDV1	YJL112W	MRPL4	P36517	319 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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