RNA–Protein interactions for RNA: YGR009C

SEC9, Transcript of t-SNARE protein required for secretory vesicle-plasma membrane fusion, yeast

Gene SEC9, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC9	YGR009C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ERP6	P53198	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	BBP1	Q12365	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	DRS2	P39524	1355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	KIN28	P06242	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	CHS2	P14180	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	TUP1	P16649	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	TRK2	P28584	889 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	SLC1	P33333	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MYO3	P36006	1272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	FES1	P38260	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	FMO1	P38866	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	AXL2	P38928	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RGI2	P40188	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	LRO1	P40345	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	DSD1	P53095	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	CUL3	P53202	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YGR111W	P53265	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RUB1	Q03919	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	PEX12	Q04370	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	TOS4	Q06266	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	PUN1	Q06991	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RSA1	Q08932	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	HUA2	Q12134	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ARG8	P18544	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RAD57	P25301	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MKS1	P34072	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MRPL7	P36519	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	SNL1	P40548	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RRN7	P40992	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MND1	P53102	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ORC4	P54791	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YMD8	Q03697	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	URH1	Q04179	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	CSI1	Q04368	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	BDS1	Q08347	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RAD18	P10862	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	RGR1	P19263	1082 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	FUN26	P31381	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	KAP122	P32767	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	KKQ8	P36004	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ALY1	P36117	915 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MUP3	P38734	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YHL008C	P38750	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	DUN1	P39009	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ALG8	P40351	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	SMK1	P41808	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YFL052W	P43551	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YJR154W	P47181	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	CCC1	P47818	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ACS1	Q01574	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	CTF19	Q02732	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MMT1	Q03218	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	AKR2	Q12013	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	PCT1	P13259	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SEC9	YGR009C	SIR1	P21691	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ARE1	P25628	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	TCA17	P32613	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ATO2	P32907	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	KTR2	P33550	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	ELF1	P36053	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	STB6	P36085	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	FIG1	P38224	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC9	YGR009C	AME1	P38313	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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