RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	DAL7	P21826	554 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	DGR2	P32330	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SMI1	P32566	505 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TGL1	P34163	548 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PHO11	P35842	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MRPL16	P38064	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	COS111	P38308	924 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PHO12	P38693	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YER158C	P40095	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YJL068C	P40363	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MND2	P40577	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TEL2	P53038	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	LSC2	P53312	427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	VPS75	P53853	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YNL146W	P53906	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MFM1	Q02783	413 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YML108W	Q03759	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ARA2	Q04212	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CIA1	Q05583	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SUE1	Q06524	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	OPT2	Q06593	877 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	AFT2	Q08957	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ISA2	Q12425	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PHO5	P00635	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GCN4	P03069	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
SUR2	YDR297W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SED4	P25365	1065 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PMT1	P33775	817 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PCH2	P38126	564 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YMR262W	P38430	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ERG7	P38604	731 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SIP3	P38717	1229 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MNL1	P38888	796 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SUR2	P38992	349 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GAA1	P39012	614 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YEL068C	P39977	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YER010C	P40011	234 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PRM2	P40534	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MAD3	P47074	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YJR098C	P47139	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TAF4	P50105	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MUK1	Q02866	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	AIM33	Q04516	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TRI1	Q05024	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	VID22	Q05934	901 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SYO1	Q07395	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YPD1	Q07688	167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
SUR2	YDR297W	RRT8	Q08219	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HUA2	Q12134	243 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MDY2	Q12285	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SKM1	Q12469	655 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	AVL9	Q12500	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	FBP1	P09201	348 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CKA1	P15790	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	MET8	P15807	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PHO13	P19881	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CLB4	P24871	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
SUR2	YDR297W	RPC34	P32910	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	CSE1	P33307	960 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	NNK1	P36003	928 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	ALG14	P38242	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SUL1	P38359	859 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	VMA22	P38784	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GIP4	P39732	760 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	THI6	P41835	540 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	KAP114	P53067	1004 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	SOL4	P53315	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	YNR068C	P53754	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	BSC5	P53755	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	TOF2	Q02208	771 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	FMP30	Q02883	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUR2	YDR297W	INA17	Q02888	182 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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