RNA–Protein interactions for RNA: YOR038C

HIR2, Transcript of Subunit of HIR nucleosome assembly complex, yeast

Gene HIR2, Length 2,628 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIR2	YOR038C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HIR2	YOR038C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SLY41	P22215	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	AGP1	P25376	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PRR1	P28708	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SLA2	P33338	968 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PHO11	P35842	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PHO12	P38693	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ALR2	P43553	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
HIR2	YOR038C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	STP1	Q00947	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	TBF1	Q02457	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	BI4	P03879	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MET17	P06106	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	CHS1	P08004	1131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	DAL2	P25335	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	STE50	P25344	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RRT12	P25381	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MAC1	P35192	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	VBA5	P36172	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	APN2	P38207	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RGD1	P38339	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SOH1	P38633	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	KAP114	P53067	1004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MET13	P53128	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	LCL3	P53153	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YNR061C	P53747	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SHE9	Q04172	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GYL1	Q04322	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RSF1	Q05043	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SIL1	Q08199	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	TRE1	Q08919	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RMP1	Q12530	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	IME1	P21190	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	EXO5	P38289	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	JHD1	P40034	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YFL052W	P43551	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SAD1	P43589	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	VPS60	Q03390	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GCR1	P07261	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SFL1	P20134	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MRPL40	P36534	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YBR225W	P38321	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	BIT2	P38346	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	NDC80	P40460	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YGR067C	P53243	804 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	UFO1	Q04511	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	AIM32	Q04689	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SOV1	Q04748	898 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	TAF10	Q12030	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	VPS54	Q12071	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	BI2	P03873	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ERG11	P10614	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ISC10	P32645	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	HEL1	P36113	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	YBR138C	P38277	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SNZ3	P43545	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ZAP1	P47043	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SNF12	P53628	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SNZ2	P53824	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	SKS1	Q12505	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	JIP3	O13555	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	CDC9	P04819	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	ARG81	P05085	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GAC1	P28006	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HIR2	YOR038C	MSN4	P33749	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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