RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SRL4	Q03085	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RAD30	Q04049	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GIM5	Q04493	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ERV41	Q04651	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	VIK1	Q12045	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	NFS1	P25374	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YME1	P32795	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SEF1	P34228	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	NUP133	P36161	1157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TAE1	P38340	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YEL076C	P39971	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ASG1	P40467	964 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	BST1	P43571	1029 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YJR124C	P47159	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	BIO3	P50277	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MRK1	P50873	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YNL146W	P53906	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ORC4	P54791	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RCO1	Q04779	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GTO3	Q04806	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MED4	Q12343	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RSR1	P13856	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GID7	P25569	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ADD66	P36040	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YKL070W	P36087	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	THI2	P38141	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YBL029W	P38201	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	VID24	P38263	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SLZ1	P40167	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YIL165C	P40446	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PET117	Q02771	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DSE3	Q08729	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RAD61	Q99359	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RIT1	P23796	513 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YKR051W	P36142	418 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ALG3	P38179	458 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PET100	P38958	111 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YFR018C	P43599	363 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	LOH1	P47055	219 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SAM50	P53969	484 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	BET4	Q00618	327 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ATG29	Q12092	213 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NTO1	Q12311	748 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	VPS63	O13549	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	APA2	P22108	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	DGR2	P32330	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	KKQ8	P36004	724 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RRT2	P38332	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RRT14	P40470	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	BNA6	P43619	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GLO1	P50107	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YGR012W	P53206	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YNR071C	P53757	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	XYL2	Q07993	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	DCI1	Q08558	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	COX17	Q12287	69 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YCR061W	P25639	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	ALY2	P47029	1046 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	NIT3	P49954	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PPM1	Q04081	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	GMC2	Q06201	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	MET3	P08536	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	YGR117C	P53270	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STB2	YMR053C	TRI1	Q05024	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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