RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeastyeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTR2YKR093W ISN1Q99312 450 aa5.8□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W YRF1-4O13559 1382 aa5.8□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W STE4P18851 423 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W CLB1P24868 471 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W ERG4P25340 473 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W CDC15P27636 974 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W PDB1P32473 366 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MDL1P33310 695 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W YKL100CP34248 587 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W ERC1P38767 581 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W SSU1P41930 458 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W STR3P53101 465 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W ART5P53244 586 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W RIA1P53893 1110 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W YDL242WQ07746 117 aa5.79□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W COX1P00401 534 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W APL3P38065 1025 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W RFC1P38630 861 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W YNG2P38806 282 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W LCB2P40970 561 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MSE1P48525 536 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MSY1P48527 492 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W BAG7Q12128 409 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W Q0010Q9ZZX9 128 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W TOD6P34219 525 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W HES1P35843 434 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W MNN2P38069 597 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W AGP2P38090 596 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W YIL166CP40445 542 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W THI6P41835 540 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W INP52P50942 1183 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W UBP16Q02863 499 aa5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTR2YKR093W URA7P28274 579 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W LOT5P34234 306 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W SEC28P40509 296 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W MAF1P41910 395 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W OAZ1Q02803 292 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W TRS23Q03784 219 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W VPS38Q05919 439 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W SWA2Q06677 668 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W ATG29Q12092 213 aa5.77□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W CYB2P00175 591 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W AAC1P04710 309 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W SRP54P20424 541 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W YCR051WP25631 222 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W SIP1P32578 815 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W PES4P39684 611 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W GDI1P39958 451 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W MAM1P40065 302 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W ZIM17P42844 174 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W TGS1Q12052 315 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W CHO2P05374 869 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W PCT1P13259 424 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W ATG4P53867 494 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W PEX25Q02969 394 aa5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W LAM4P38800 1345 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W GAL80P04387 435 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W ALG7P07286 448 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W EST1P17214 699 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W AAD3P25612 363 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W RPF2P36160 344 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W OMA1P36163 345 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W APE3P37302 537 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W AAP1P37898 856 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W PET130P47065 347 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W CTR1P49573 406 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W GYL1Q04322 720 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W FMP45Q07651 309 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W CRT10Q08226 957 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W LCB4Q12246 624 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W AVL9Q12500 764 aa5.75□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data5.74□□□□□ -1.49not detected
PTR2YKR093W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W VMA16P23968 213 aa5.74□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W SYN8P31377 255 aa5.74□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W PUP2P32379 260 aa5.74□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W WBP1P33767 430 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTR2YKR093W TCD2P36101 447 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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