RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	SWH1	P35845	1188 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SLX1	P38324	304 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SHU2	P38957	223 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YDR089W	P38966	869 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	FHL1	P39521	936 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MEF2	P39677	819 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	VPS25	P47142	202 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	NUT1	P53114	1132 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	USE1	P53146	245 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ERP6	P53198	216 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.6	□□□□□ -1.35	not detected
MIA40	YKL195W	FMN1	Q03778	218 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	TVP15	Q03860	143 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RSC2	Q06488	889 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SWC7	Q06707	132 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SVS1	Q12254	260 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.59	□□□□□ -1.35	not detected
MIA40	YKL195W	AMD2	P22580	549 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HMT1	P38074	348 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YBR284W	P38150	797 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	GIP1	P38229	639 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	BZZ1	P38822	633 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SIW14	P53965	281 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	CDC14	Q00684	551 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MET14	Q02196	202 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	INP2	Q03824	705 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	NHX1	Q04121	633 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HFD1	Q04458	532 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	APC9	Q12107	265 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.59	□□□□□ -1.35	not detected
MIA40	YKL195W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	AFI1	Q99222	893 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RIF1	P29539	1916 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MPH2	P0CD99	609 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	INO1	P11986	533 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MSH2	P25847	964 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	BUD14	P27637	709 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SIN4	P32259	974 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	DGR2	P32330	852 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	DSS4	P32601	143 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GDA1	P32621	518 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	FUI1	P38196	639 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YHI9	P38765	294 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TRM5	P38793	499 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YHR182W	P38870	785 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MGS1	P40151	587 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ALG5	P40350	334 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	AXL1	P40851	1208 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CHS6	P40955	746 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RTT101	P47050	842 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YNL058C	P53947	316 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RSC4	Q02206	625 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	HOT1	Q03213	719 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GCN5	Q03330	439 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MCA1	Q08601	432 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PGC1	Q08959	321 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	APM4	Q99186	491 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	COX5A	P00424	153 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MAS1	P10507	462 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RAD14	P28519	371 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SWE1	P32944	819 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ASK1	P35734	292 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ADD66	P36040	267 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TAT1	P38085	619 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MRP21	P38175	177 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ALG14	P38242	237 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YBR225W	P38321	900 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YIL001W	P40560	513 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MDJ2	P42834	146 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PRY1	P47032	299 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YJR142W	P47173	342 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MIG2	P53035	382 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TIM13	P53299	105 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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