RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	LSO1	Q3E827	93 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	LAA1	P39526	2014 aa		6.65	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	NPP1	P25353	742 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YIH1	P25637	258 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SEC6	P32844	805 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	CYM1	P32898	989 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HSP78	P33416	811 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	LDH1	P38139	375 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RFC3	P38629	340 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PPE1	P38796	400 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	LAM1	P38851	1228 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YEL028W	P39989	153 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	FIR1	P40020	876 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MAF1	P41910	395 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YJL107C	P42947	387 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YFL012W	P43580	148 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	CNN1	P43618	361 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HRD3	Q05787	833 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YLR177W	Q06251	628 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PEX15	Q08215	383 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	GNT1	Q12096	491 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SLP1	Q12232	587 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RGS2	Q99188	309 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SNT1	P25357	1226 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ADY2	P25613	283 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PAH1	P32567	862 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	AIM26	P32858	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	UIP5	P36137	443 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RDH54	P38086	958 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RIM4	P38741	713 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	STN1	P38960	494 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ATM1	P40416	690 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SPO74	P45819	413 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MRM2	P53123	320 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	VPS62	P53285	467 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RCF2	P53721	224 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YNL144C	P53907	740 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YMR209C	Q03648	457 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	TAF11	Q04226	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ARP9	Q05123	467 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PMT7	Q06644	662 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	OSW1	Q08692	278 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HRT3	Q12347	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	KCS1	Q12494	1050 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	APE1	P14904	514 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	EXO70	P19658	623 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.62	□□□□□ -1.35	not detected
MIA40	YKL195W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PHO89	P38361	574 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YHR202W	P38887	602 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	FRT2	P39734	528 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	TEL2	P53038	688 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ARA2	Q04212	335 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	AIM32	Q04689	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	REC107	P21651	314 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MSN1	P22148	382 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MLS1	P30952	554 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MET4	P32389	672 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	PHA2	P32452	334 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	SMI1	P32566	505 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YSC84	P32793	468 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YBR056W	P38081	501 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RIM2	P38127	377 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	YHL008C	P38750	627 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	QDR1	P40475	563 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	HOS4	P40480	1083 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	MAD3	P47074	515 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	DOS2	P54858	310 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	CDC123	Q05791	360 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	GRX8	Q05926	109 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ATP12	P22135	325 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	ADK2	P26364	225 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MIA40	YKL195W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35

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