RNA–Protein interactions for RNA: YGL229C

SAP4, Transcript of Protein required for function of the Sit4p protein phosphatase, yeast

Gene SAP4, Length 2,457 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAP4	YGL229C	YHI9	P38765	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PEX28	P38848	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	NUP100	Q02629	959 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SPC24	Q04477	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TRE2	Q08693	809 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	LDB17	Q12342	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FRT1	Q99332	602 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PMR1	P13586	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	EXO70	P19658	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YSP3	P25036	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TOM20	P35180	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YHR182W	P38870	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HAT2	P39984	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MOB1	P40484	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SIP4	P46954	829 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	COQ6	P53318	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TRS31	Q03337	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FMN1	Q03778	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TVP15	Q03860	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	IRC10	Q08118	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FLC1	Q08967	793 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	REV1	P12689	985 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	AAD3	P25612	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	COQ8	P27697	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	AEP1	P32493	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	KTR4	P38131	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YJL206C	P39529	758 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YNR063W	P53749	607 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	UBX4	P54730	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
SAP4	YGL229C	PEX34	P25584	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GDA1	P32621	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	CTP1	P38152	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YBP1	P38315	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HEM14	P40012	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	FAR3	P46671	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TEL2	P53038	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ORC3	P54790	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MCP2	Q06567	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PEX15	Q08215	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	KEX2	P13134	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	BAS1	P22035	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TOA1	P32773	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YGL015C	P33199	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HXT5	P38695	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RGI2	P40188	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MEP1	P40260	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	NDD1	Q08887	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ATG34	Q12292	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PEX11	Q12462	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RMD5	Q12508	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	DAL81	P21657	970 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	GUT2	P32191	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PHO89	P38361	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SLX8	P40072	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	COG1	P53079	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PRM1	P53835	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	DOS2	P54858	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YIG1	Q08956	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MCD1	Q12158	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	ABF1	P14164	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PEX1	P24004	1043 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MNE1	P24720	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	SNT1	P25357	1226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	PHO87	P25360	923 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SAP4	YGL229C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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