RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GRX8	Q05926	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AAD4	Q07747	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NSL1	Q12143	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	STB3	Q12427	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CTF3	Q12748	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	POX1	P13711	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NMT1	P14743	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RGR1	P19263	1082 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ATP12	P22135	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MEF1	P25039	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GAC1	P28006	793 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MSS51	P32335	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RPC82	P32349	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SRP101	P32916	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GPT2	P36148	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SLM4	P38247	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PPE1	P38796	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	LAM1	P38851	1228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YAP1801	P38856	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MXR1	P40029	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MPH1	P40562	993 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	FMP32	P43557	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YGR127W	P53275	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MUB1	Q03162	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	DYN3	Q04949	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CDD1	Q06549	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NSE1	Q07913	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
UBX7	YBR273C	MSH5	Q12175	901 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MAS2	P11914	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SEC15	P22224	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	VPS3	P23643	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	UTR2	P32623	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AGP2	P38090	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	FUI1	P38196	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RAD55	P38953	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MNN1	P39106	762 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	FAA2	P39518	744 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YJR061W	P40355	935 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	UBP7	P40453	1071 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	IMA1	P53051	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GET1	P53192	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SLG1	P54867	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MSC2	Q03455	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	NHX1	Q04121	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YET2	Q04210	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SEC10	Q06245	871 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CDA1	Q06702	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ASA1	Q06822	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ENT4	Q07872	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	APC9	Q12107	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	LDB17	Q12342	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ATP6	P00854	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TPK2	P06245	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MSS18	P08593	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	KSS1	P14681	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FAR1	P21268	830 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CNA1	P23287	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CLB2	P24869	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PHO91	P27514	894 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RAD16	P31244	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PUP2	P32379	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FLR1	P38124	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FES1	P38260	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YHI9	P38765	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PNT1	P38969	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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