RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.94■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 TC2NQ8N9U0 490 aa31.94■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 SDR42E1Q8WUS8 393 aa31.94■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 VWA3AA6NCI4 1184 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 PDILTQ8N807 584 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 FERMT2Q96AC1 680 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GUL6 1792 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CALM1P0DP23 149 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CALM2P0DP24 149 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CALM3P0DP25 149 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8FQ08AF8 430 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 PKN1Q16512 942 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CATIPQ7Z7H3 387 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 RAI14Q9P0K7 980 aa31.93■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CACNA1SQ13698 1873 aa31.92■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 FUT2Q10981 343 aa31.92■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ZNF827Q17R98 1081 aa31.92■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa31.92■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 NHSQ6T4R5 1651 aa31.92■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa31.92■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ATP2B1P20020 1258 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 NR1I3Q14994 352 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 LRRN4CLQ8ND94 238 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ABCF2Q9UG63 623 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GTH6 734 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 SLFN14P0C7P3 912 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 USP49Q70CQ1 688 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 MNS1Q8NEH6 495 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 UBXN4Q92575 508 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 BRMS1Q9HCU9 246 aa31.91■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 TPM1P09493 284 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 SHISA4Q96DD7 197 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 MED15Q96RN5 788 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ZNF446Q9NWS9 450 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 VPS54Q9P1Q0 977 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 BTAF1O14981 1849 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 URI1O94763 535 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 FGRP09769 529 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 UBE4AQ14139 1066 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 IQCA1Q86XH1 822 aa31.9■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB8A8MWE9 144 aa31.89■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 NPHP1O15259 732 aa31.89■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 PTPN21Q16825 1174 aa31.89■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
UBP1-201ENST00000283628 SPATA1Q5VX52 437 aa31.88■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 PTF1AQ7RTS3 328 aa31.88■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 DHX58Q96C10 678 aa31.88■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 FANCGO15287 622 aa31.88■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 DDAH1O94760 285 aa31.88■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 RGL2O15211 777 aa31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 TADA3O75528 432 aa31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 GSDMAQ96QA5 445 aa31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 SCN7AQ01118 1682 aa31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 PAGE5Q96GU1 130 aa31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 PANX2Q96RD6 677 aa31.87■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CASQ1P31415 396 aa31.86■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CLCN6P51797 869 aa31.86■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 ADKP55263 362 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CAVIN4Q5BKX8 364 aa31.86■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.86■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 FAM205CA6NFA0 338 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 SEMA3EO15041 775 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 GYG1P46976 350 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 TROAPQ12815 778 aa31.85■■■□□ 2.69
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UBP1-201ENST00000283628 EPSTI1Q96J88 318 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 V9GY48 417 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 A0A087X0B3 334 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CUL4BQ13620 913 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF25Q93038 417 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CTAGE1Q96RT6 745 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 COL4A1P02462 1669 aa31.85■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHA8P1O95397 391 aa31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 GNG11P61952 73 aa31.84■■■□□ 2.69
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