RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	SUA5	P32579	426 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	COT1	P32798	439 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NUF2	P33895	451 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YEL1	P34225	687 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GCS1	P35197	352 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UGA2	P38067	497 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	AXL2	P38928	823 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	FET5	P43561	622 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YGL242C	P53066	181 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PIB2	P53191	635 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CUL3	P53202	744 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YNL146W	P53906	100 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
YPT53	YNL093W	MAK10	Q02197	733 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YAP6	Q03935	383 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GTB1	Q04924	702 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	IVY1	Q04934	453 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	BSC2	Q05611	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PEX15	Q08215	383 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PCD1	Q12524	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GCN4	P03069	281 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ARG80	P07249	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YER152C	P10356	443 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DAL81	P21657	970 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DAD2	P36162	133 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ERC1	P38767	581 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CCC2	P38995	1004 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PRM9	P39551	298 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	EFM4	P40516	257 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	AGE2	P40529	298 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	THI6	P41835	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SSU1	P41930	458 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TAF4	P50105	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	KAP114	P53067	1004 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PGA2	P53903	129 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GIS1	Q03833	894 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	URC2	Q04411	772 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GRS2	Q06817	618 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	VHS3	Q08438	674 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TRM8	Q12009	286 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ARP7	Q12406	477 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GRX6	Q12438	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LAG2	Q92325	660 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
YPT53	YNL093W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GPA1	P08539	472 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YCL049C	P25577	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PCL2	P25693	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SRB2	P34162	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TOD6	P34219	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	STB6	P36085	766 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ERT1	P38140	529 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RFC3	P38629	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PEX28	P38848	579 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YHR182W	P38870	785 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UME6	P39001	836 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MRX1	P40050	688 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ALG5	P40350	334 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ASK10	P48361	1146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HDA1	P53973	706 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RTT103	Q05543	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.3 ms