RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CDC16	P09798	840 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	ERG8	P24521	451 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	DMC1	P25453	334 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MRPL9	P31334	269 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MRP20	P32387	263 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SIP1	P32578	815 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MTH1	P35198	433 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	OAR1	P35731	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	BUD16	P39988	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MAM1	P40065	302 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	NDE1	P40215	560 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YJR061W	P40355	935 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	ASE1	P50275	885 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	TMN2	Q04562	672 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	PCL8	Q08966	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SWT1	Q12104	458 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	INH1	P01097	85 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	FMP10	P40098	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	NPA3	P47122	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YGL117W	P53133	265 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CPR8	P53728	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	BSC5	P53755	489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	WAR1	Q03631	944 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	GTB1	Q04924	702 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MED1	Q12321	566 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SKM1	Q12469	655 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	COX1	P00401	534 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SPO16	P17122	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	IMP2'	P32351	346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	EMP70	P32802	667 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MUP3	P38734	546 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	LAS21	P40367	830 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YFL015C	P43578	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	COG2	P53271	262 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	ENT4	Q07872	247 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	VCX1	Q99385	411 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	GEX2	P36173	615 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ERC1	P38767	581 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SIP4	P46954	829 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	UBX6	P47049	396 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	VPS4	P52917	437 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	GIS1	Q03833	894 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RAD33	Q04231	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RCO1	Q04779	684 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	NBP2	Q12163	236 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	LCB4	Q12246	624 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ALY1	P36117	915 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ESL2	P36168	1195 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	TDP1	P38319	544 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ESL1	P40456	1118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	AAT1	Q01802	451 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YSA1	Q01976	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	PLM2	Q04383	521 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ATG23	Q06671	453 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	NUS1	Q12063	375 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SEM1	O94742	89 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	YNR061C	P53747	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	FCP1	Q03254	732 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	RAD30	Q04049	632 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL035C	YNL035C	ARG7	Q04728	441 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms