RNA–Protein interactions for RNA: YML067C

ERV41, Transcript of Protein localized to COPII-coated vesicles, yeast

Gene ERV41, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERV41	YML067C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	CAB2	P40506	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	UBX6	P47049	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	NPA3	P47122	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	PEX8	P53248	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	TEP1	P53916	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERV41	YML067C	COX1	P00401	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	GAL4	P04386	881 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YKL133C	P36066	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	PXL1	P36166	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YIR016W	P40572	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	ATG21	Q02887	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	POL3	P15436	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	LAC1	P28496	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	ARA2	Q04212	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	THI3	Q07471	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	ATX2	Q12067	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
ERV41	YML067C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	RRI1	Q12468	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	SIR1	P21691	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	TOM20	P35180	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	GRX7	P38068	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YJL107C	P42947	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MDV1	P47025	714 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YNL144C	P53907	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	CNA1	P23287	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YUR1	P26725	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	APM3	P38153	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	UBP7	P40453	1071 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	SKP2	P42843	763 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	STB2	P46679	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	HIM1	Q06674	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	SNA4	Q07549	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	RIT1	P23796	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	ARN1	P38731	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	HIS6	P40545	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MEP2	P41948	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YGR079W	P53249	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YPR003C	P53394	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	BOP3	P53958	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	VTC3	Q02725	835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MSH1	P25846	959 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	YPT11	P48559	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	PDR8	Q06149	701 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	UBX3	Q12229	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	HES1	P35843	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MET14	Q02196	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	MLC2	Q06580	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERV41	YML067C	GAL1	P04385	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	PIF1	P07271	859 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	PET122	P10355	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	URK1	P27515	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	ATO2	P32907	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	QRI7	P43122	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	NUP53	Q03790	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	SUL2	Q12325	893 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	GTB1	Q04924	702 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	SRL1	Q08673	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	BUD7	Q08754	746 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	YCR006C	P25350	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	PTP2	P29461	750 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	OCT1	P35999	772 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	VPS25	P47142	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	TAM41	P53230	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	GSH2	Q08220	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	MCH4	Q08268	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ERV41	YML067C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.4 ms