RNA–Protein interactions for RNA: YLR265C

NEJ1, Transcript of Protein involved in regulation of nonhomologous end joining, yeast

Gene NEJ1, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEJ1	YLR265C	ORC5	P50874	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	FOL1	P53848	824 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	RRI1	Q12468	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YCR043C	P25361	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	MAF1	P41910	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YNL034W	P53963	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	CRD1	Q07560	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	NDD1	Q08887	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SCO2	P38072	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	TAF5	P38129	798 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	ARN1	P38731	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YLF2	P38746	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	AIM6	Q07716	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	AAD4	Q07747	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SDS22	P36047	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SWD1	P39706	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	NPA3	P47122	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YPT11	P48559	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YPR003C	P53394	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	VPS64	Q03944	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YAT2	P40017	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SIP1	P32578	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	SAW1	P39735	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	CDC1	P40986	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	ICL2	Q12031	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEJ1	YLR265C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	THI3	Q07471	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	MLH2	Q07980	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	DSE3	Q08729	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	COX1	P00401	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	PDE1	P22434	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	VPS41	P38959	992 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	ASK10	P48361	1146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	PDR8	Q06149	701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	GSH2	Q08220	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	MET30	P39014	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	YNL144C	P53907	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	TGL2	P54857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	LAC1	P28496	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	MSS51	P32335	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	SWC3	P31376	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	NIC96	P34077	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	HES1	P35843	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	NRT1	Q08485	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	ARP7	Q12406	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	OCT1	P35999	772 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	PIG1	Q06216	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	YIL169C	P40442	995 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	SND1	Q04007	877 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	MPD2	Q99316	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEJ1	YLR265C	MAD3	P47074	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	GRS2	Q06817	618 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	PEX8	P53248	589 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YGR079W	P53249	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	URK1	P27515	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	UBX6	P47049	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
NEJ1	YLR265C	MCH4	Q08268	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	FRE3	Q08905	711 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YCR006C	P25350	157 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	BUD16	P39988	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	QRI7	P43122	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	VPS25	P47142	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	MSY1	P48527	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	GTB1	Q04924	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NEJ1	YLR265C	SIR1	P21691	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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