RNA–Protein interactions for RNA: YJR138W

IML1, Transcript of GTPase-activating protein (GAP), subunit of SEA and Iml1p complexes, yeast

Gene IML1, Length 4,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IML1	YJR138W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MED6	P38782	295 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YPT11	P48559	417 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPN14	P53196	417 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPP2	Q02521	185 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YDR090C	Q03193	310 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GCN5	Q03330	439 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SIL1	Q08199	421 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GNT1	Q12096	491 aa		1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	1.26	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PLC1	P32383	869 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SRP101	P32916	621 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CTF13	P35203	478 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CSG2	P35206	410 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SEA4	P38164	1038 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HSE1	P38753	452 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PRK1	P40494	810 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YIL086C	P40503	102 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CDC1	P40986	491 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CPR7	P47103	393 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	VEL1	P53058	206 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YNL092W	P53934	400 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SLT2	Q00772	484 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.25	□□□□□ -2.21	not detected
IML1	YJR138W	AIM39	Q08223	395 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BUD7	Q08754	746 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YLR046C	Q12253	270 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GAL7	P08431	366 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GEX1	P25596	615 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GEX2	P36173	615 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SWC5	P38326	303 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YEL020C	P39994	560 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	LRO1	P40345	661 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	KTR7	P40504	517 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SNZ3	P43545	298 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MET12	P46151	657 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	STU2	P46675	888 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BSC5	P53755	489 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SNZ2	P53824	298 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	EFM6	P53970	246 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	INA17	Q02888	182 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CDD1	Q06549	142 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TPO1	Q07824	586 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	VPS54	Q12071	889 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SEC63	P14906	663 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPS22	P25380	463 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ADD66	P36040	267 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	AIM18	P38884	321 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPG5	P42933	373 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MPS1	P54199	764 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SMA1	Q02651	245 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	CDC73	Q06697	393 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YRR1	Q12172	810 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YDR262W	Q12331	272 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RLF2	Q12495	606 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	KRE6	P32486	720 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SPR1	P32603	445 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	KAP122	P32767	1081 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BEM3	P32873	1128 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SKT5	P34226	696 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BEM4	P39011	633 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PFD1	P46988	109 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	MNT2	P53059	558 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PUS9	Q12069	462 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	HOS1	Q12214	470 aa		1.25	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	TAF13	P11747	167 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	YCK1	P23291	538 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	PPH21	P23594	369 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	SMC1	P32908	1225 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	FTH1	P38310	465 aa		1.24	□□□□□ -2.21
IML1	YJR138W	BDH2	P39713	417 aa		1.24	□□□□□ -2.21

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